当前解析结果
SmilChr02G002146| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002146 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002146 |
| 描述 | 8-hydroxyquercetin 8-O-methyltransferase-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 38595015 - 38605241 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008416 |
|---|---|
| GeneID | 131008416 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008416 |
| 原始查询 | SmilChr02G002146 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 8-hydroxyquercetin 8-O-methyltransferase-like |
| 产物 | 8-hydroxyquercetin 8-O-methyltransferase-like |
| Arabidopsis | AT4G35160 (AT4G35160)O-methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829668] identity=28.4; qcov=0.994; evalue=7.18e-14; confidence=low |
| Rice | Os01g0753300- identity=34.2; qcov=1.04; evalue=5.55e-29; confidence=low |
| GO | GO:0008171 (O-methyltransferase activity); GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0019438 (GO:0019438); GO:0032259 (methylation); GO:0046983 (protein dimerization activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08100 (Dimerisation) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008416 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057791281.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057791281.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791281.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791281.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791281.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:38604663 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B43 |
Chr2:38604663 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B43 |
Chr2:38604769 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr2:38604812 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C15 |
Chr2:38604853 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr2:38604873 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B15,B56,B64 |
Chr2:38604892 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr2:38605087 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C53 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057791281.1PF08100
Dimerisation 21-108 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057791281.1 |
Pfam | PF08100 |
Dimerisation | Domain | 21 | 108 | 1.8e-20 | 73.4 | O-methyltransferase dimerisation domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。