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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002157`

染色体: Chr02 坐标: 38797823-38799308 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002157`
名称	SmilChr02G002157
描述	protein SLOW WALKER 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	38797823 - 38799308 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008418`
GeneID	`131008418`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008418`
原始查询	`SmilChr02G002157`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SLOW WALKER 1-like
产物	protein SLOW WALKER 1-like
Arabidopsis	`AT2G47990` (SWA1) transducin family protein / WD-40 repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819411] identity=51.1; qcov=0.837; evalue=1.4e-64; confidence=high
Rice	`Os07g0224900` (OsWD40-138) - identity=44.2; qcov=0.875; evalue=5.75e-52; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0045943 (positive regulation of transcription by RNA polymerase I)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008418

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791282.1`
2	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057791282.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791282.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791282.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791282.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:38797876`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A6,B118,B133,B134,B18,B19,B26,B34,B36,B52,B57,B64,B69,B74,B75,B77,B86,B88,B91,B94,C15,C28,C41,C45,C46,C5,C51,C64,D2,D3,D5
`Chr2:38797907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B57,C16,C30
`Chr2:38797914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:38797927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr2:38797947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:38797996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr2:38798007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:38798065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B53
`Chr2:38798068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,C85
`Chr2:38798079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C9,D10
`Chr2:38798085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr2:38798090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791282.1

264 aa

132

264

WD40

PF00400 WD40 82-107 aa PF00400 WD40 113-151 aa PF00400 WD40 156-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791282.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	82	107	2.3e-21	76.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057791282.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	113	151	2.3e-21	76.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057791282.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	156	194	2.3e-21	76.0	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935299.1
TCTCTCTTCCCCCTCTTCCCTTCCAAACTCACTCCAACGCCGGAGGCCAAGTACTGGAGATCATTCAAAATCCCTAAAGATATCGAAACCACACCATCAAAATCCTTCACTTTCCCAATAAATTCGATTGCATTTTCGCCGATAGGCTCTCACGATTTCGCCGCCACGCATTCCGCCAACATATCGATCTTCTCCGACAAGACCCTTGAGCCTAAACCCACAATCTCCTCTTTCTCCGACACCGCCGTTGCCGTCTCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008418
TCTCTCTTCCCCCTCTTCCCTTCCAAACTCACTCCAACGCCGGAGGCCAAGTACTGGAGATCATTCAAAATCCCTAAAGATATCGAAACCACACCATCAAAATCCTTCACTTTCCCAATAAATTCGATTGCATTTTCGCCGATAGGCTCTCACGATTTCGCCGCCACGCATTCCGCCAACATATCGATCTTCTCCGACAAGACCCTTGAGCCTAAACCCACAATCTCCTCTTTCTCCGACACCGCCGTTGCCGTCTCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791282.1
SLFPLFPSKLTPTPEAKYWRSFKIPKDIETTPSKSFTFPINSIAFSPIGSHDFAATHSANISIFSDKTLEPKPTISSFSDTAVAVSFRCDGKLLAAGDLTGTVHVFDAKSRSHLRRLKGHAAAVRSVSYPRAADKLHLFSGGDDSVVKYWDVTIEKCVFNLLGHKDYVRCSDASPISDEMFVSGSYDHSVRVWDVRVSNASSVMELNHEKPIESVIYLPSGGLIATAVREREGEDGEDGEEREGCFVFYSTSSNSTPLSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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