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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002198`

染色体: Chr02 坐标: 39225795-39226538 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002198`
名称	SmilChr02G002198
描述	uncharacterized SmilChr02G002198
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39225795 - 39226538 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008430`
GeneID	`131008430`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008430`
原始查询	`SmilChr02G002198`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=51.4; qcov=0.599; evalue=6.67e-32; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=48.5; qcov=0.818; evalue=2.91e-59; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008430

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791294.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057791294.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057791294.1`
4	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057791294.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791294.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39225805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A4,B79,C87
`Chr2:39225808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,B98
`Chr2:39225824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:39225861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A18,A4,B131,B79,C52
`Chr2:39225861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A4,B131,B79,C52
`Chr2:39225889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C62
`Chr2:39225913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C52
`Chr2:39225922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B49,B79,C3,C52
`Chr2:39225932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr2:39225940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,B98
`Chr2:39225944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr2:39225951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A18,A4,B49,B79,C3,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791294.1

247 aa

124

247

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 58-96 aa PF04827 Plant_tran 165-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791294.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	58	96	2.7e-20	72.5	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057791294.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	165	209	8.1e-14	52.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935311.1
ATGTCTTCCTCCTCATCAAGCCACAAGGACGAGCGACGTGCTGAAGAATTTTCCAATCTTGTACAACAATTTAACCAAATTGTTCAAGATATTGGTGATCCAGAAGAGCAACCTCGTCGTCGGCGACGAAGCGCGCGGAAGAAGGCTTTCATTCGTCAGGACCGTGAAGCCGGCGCTGTACGTTTGCACGCGGATTACTTTGATGAAAATCCAGTCTACCCCGACAACATCTTCCGCCGCCGTTTTCGGATGCGTCGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008430
ATGTCTTCCTCCTCATCAAGCCACAAGGACGAGCGACGTGCTGAAGAATTTTCCAATCTTGTACAACAATTTAACCAAATTGTTCAAGATATTGGTGATCCAGAAGAGCAACCTCGTCGTCGGCGACGAAGCGCGCGGAAGAAGGCTTTCATTCGTCAGGACCGTGAAGCCGGCGCTGTACGTTTGCACGCGGATTACTTTGATGAAAATCCAGTCTACCCCGACAACATCTTCCGCCGCCGTTTTCGGATGCGTCGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791294.1
MSSSSSSHKDERRAEEFSNLVQQFNQIVQDIGDPEEQPRRRRRSARKKAFIRQDREAGAVRLHADYFDENPVYPDNIFRRRFRMRRALFLRIINAVASDPYFQQRMDALGRPGFTPLQKCIVAVRMLANGGAADQYDEYLWIAESTALECLRRFSRAIIQLFGAEYLRRPTSADCQRLLAMHEAKHGFPGMLGSLDCMHWAWKNCPNGMARRIHSRRSGGTDHHPRSCRLARSMDLACFFWDSWFEQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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