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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002208`

染色体: Chr02 坐标: 39338686-39341238 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002208`
名称	SmilChr02G002208
描述	equilibrative nucleotide transporter 3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39338686 - 39341238 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012385`
GeneID	`131012385`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012385`
原始查询	`SmilChr02G002208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	equilibrative nucleotide transporter 3-like
产物	equilibrative nucleotide transporter 3-like
Arabidopsis	`AT4G05120` (FUR1) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825857] identity=62.5; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0557100` - identity=62.1; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005337 (nucleoside transmembrane transporter activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:1901642 (nucleoside transmembrane transport)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01733 (Nucleoside_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012385

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057796298.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057796298.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057796298.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796298.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796298.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39339238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:39339339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C27,C83
`Chr2:39339647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr2:39339667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A22,B140,B32,B37,B40,B6,C62,C63
`Chr2:39339845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B41,B61,C51
`Chr2:39339945`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr2:39339945`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr2:39340059`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C24
`Chr2:39340059`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C24
`Chr2:39340076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:39340101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:39340209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796298.1

417 aa

208

417

Nucleoside_tran

PF01733 Nucleoside_tran 129-410 aa

XP_057796299.1

417 aa

208

417

Nucleoside_tran

PF01733 Nucleoside_tran 129-410 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796298.1`	Pfam	`PF01733`	Nucleoside_tran	Family	129	410	3.6e-25	89.7	Nucleoside transporter
`XP_057796299.1`	Pfam	`PF01733`	Nucleoside_tran	Family	129	410	3.6e-25	89.7	Nucleoside transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940315.1
CTTTTACTTTTCCTTTTTCTAAGAGGAGATTGCGATTCACTTGGACTCTACTTGACGTCCCGTTTTCAATAAATCTTCTTATACACCAAGCTTCAGATTTATTTATCTGCAGTCGAAATCACTCCTTTATTTCTCGATAGATTTCAGTCTCGGTAGAGTGGAGCCATGACTAACGATGGTGATCCTACCGATGCCTCAATTCCCACTAGGATTGAGGGGAGATTCAAGGCCATTGTCATATGTTGGTTTCTTGGATTAGG...

XM_057940316.1
CTTCATCTTCTCCTTTAATTTTCCTCTCCCCTTTCATCAATATCTATATTTTATGAAATTGTAGTTAATAAGATGCTGTATTTGGCCTCCAACATATAATTAATTTGACATTGTCAGTATCGAGCTTTTTTTTTTCTTCTTCCCGGAGCCCTTAAACGAAATTGTTCTACTTAATTTATAGATTTCAGTCTCGGTAGAGTGGAGCCATGACTAACGATGGTGATCCTACCGATGCCTCAATTCCCACTAGGATTGAGGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012385
ATGACTAACGATGGTGATCCTACCGATGCCTCAATTCCCACTAGGATTGAGGGGAGATTCAAGGCCATTGTCATATGTTGGTTTCTTGGATTAGGCAATCTTGTGGCGTGGAATAGCATGCTCACTATCTCCGATTATTACTATCAAGTGTTCCCGACTTACCATCCGTCGAGGGTACTTACCCTAGTCTACCAACCTTTTTCATTTGGAACCATGATATTACTTGCTTACTACGAGGCCAAGATTAATACAAGGATGCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796298.1
MTNDGDPTDASIPTRIEGRFKAIVICWFLGLGNLVAWNSMLTISDYYYQVFPTYHPSRVLTLVYQPFSFGTMILLAYYEAKINTRMRILFGYTLFSLCTLALLLVDIGTSGKGGIANYIGICVLVGGFGLADAFTQGGIVGDLSFMEPIFLQSFFGGLAASGALTSGLRLVTKWAFDKADDGLRKGVILFLSISTLFEFVCVFLYAYVFGRIPIVKHFRRKAASEGSKTVASDLAAAGIHTSYDDGTVVDRLSNMTLIRQ...

XP_057796299.1
MTNDGDPTDASIPTRIEGRFKAIVICWFLGLGNLVAWNSMLTISDYYYQVFPTYHPSRVLTLVYQPFSFGTMILLAYYEAKINTRMRILFGYTLFSLCTLALLLVDIGTSGKGGIANYIGICVLVGGFGLADAFTQGGIVGDLSFMEPIFLQSFFGGLAASGALTSGLRLVTKWAFDKADDGLRKGVILFLSISTLFEFVCVFLYAYVFGRIPIVKHFRRKAASEGSKTVASDLAAAGIHTSYDDGTVVDRLSNMTLIRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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