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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002213`

染色体: Chr02 坐标: 39374781-39375809 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002213`
名称	SmilChr02G002213
描述	uncharacterized SmilChr02G002213
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39374781 - 39375809 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008434`
GeneID	`131008434`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008434`
原始查询	`SmilChr02G002213`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0282700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0282700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G66235` (AT1G66235) no-apical-meristem-associated carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842939] identity=28.8; qcov=0.543; evalue=4.06e-11; confidence=low
Rice	`Os11g0282700` - identity=28.6; qcov=0.893; evalue=1.08e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008434

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791298.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791298.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791298.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791298.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791298.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39374785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B95,C33,D11
`Chr2:39374787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,B35
`Chr2:39374790`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	30	A1,A16,A2,A20,A7,B108,B118,B13,B131,B139,B27,B31,B37,B44,B53,B57,B59,B70,B76,B95,B98,C24,C26,C29,C31,C55,C63,C70,C82,C9
`Chr2:39374795`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A1,A14,A3,B102,B134,B23,B26,B4,B67,B68,B69,C2,C22,C41,C46,C47,C48,C50,C54,C66,C78
`Chr2:39374800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr2:39374807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B44,C44,C67
`Chr2:39374814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B69,C83
`Chr2:39374829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C86
`Chr2:39374838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B50,C25,C86,D10
`Chr2:39374859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B69
`Chr2:39374868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B44,C25,C37,C73
`Chr2:39374880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B100,B106,B125,B90

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935315.1
ATGCCGGCTAGCACCAAACGTTGCAACTATTATCCGCCAGAAACGGTGCTAATTTGCCGTTTGTATCTCGAGCACACCCACGACTCTGTGGTGGGTGTCGACCAAAAAGGGGCGAAGTTTTGGGGCTCCCTCTGCACCCAATACAACGCTAAAAGGCCCCAAGGATCTATTTCACGCGACGTCACGCAAATCAAATCTCACTTTCAACAGGTGGCGAAGGATTCGAAGAGGTTTGAGGCCATGCACAAAAAATGTCACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008434
ATGCCGGCTAGCACCAAACGTTGCAACTATTATCCGCCAGAAACGGTGCTAATTTGCCGTTTGTATCTCGAGCACACCCACGACTCTGTGGTGGGTGTCGACCAAAAAGGGGCGAAGTTTTGGGGCTCCCTCTGCACCCAATACAACGCTAAAAGGCCCCAAGGATCTATTTCACGCGACGTCACGCAAATCAAATCTCACTTTCAACAGGTGGCGAAGGATTCGAAGAGGTTTGAGGCCATGCACAAAAAATGTCACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791298.1
MPASTKRCNYYPPETVLICRLYLEHTHDSVVGVDQKGAKFWGSLCTQYNAKRPQGSISRDVTQIKSHFQQVAKDSKRFEAMHKKCHDQWKSGMSDGQITEQAEAIWLAEFRVPFRYPHAWKILHESKKFASLGEDVHSDVHSDKRSKGSDGLATTTSSDASISTRPQGQKAAKRDKGKCKKKAEETSGDNKKALGYMANMVIAMEKFSQVQRDLADSMCNAIAGMGAIEVGTTSIAPNKVHGC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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