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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002223`

染色体: Chr02 坐标: 39502948-39505762 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002223`
名称	SmilChr02G002223
描述	sugar carrier protein C-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39502948 - 39505762 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012400`
GeneID	`131012400`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012400`
原始查询	`SmilChr02G002223`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sugar carrier protein C-like
产物	sugar carrier protein C-like
Arabidopsis	`AT1G11260` (STP1) sugar transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837667] identity=78.2; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0106200` (OsMST3) - identity=71.3; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015145 (monosaccharide transmembrane transporter activity); GO:0015749 (monosaccharide transmembrane transport); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00083 (Sugar_tr); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012400

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796338.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796338.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796338.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796338.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796338.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39503145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B59,D2
`Chr2:39503232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr2:39503343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B93,B95,C15
`Chr2:39503541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B20,B34
`Chr2:39503544`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B54,B82,B84,C33
`Chr2:39503706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B93,C15
`Chr2:39503838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr2:39503949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,A24
`Chr2:39503997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A9,B89,D1
`Chr2:39505079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B93,C15
`Chr2:39505136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C33
`Chr2:39505305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B140,B91,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796338.1

523 aa

262

523

Sugar_tr

MFS_1

PF00083 Sugar_tr 28-490 aa PF07690 MFS_1 78-436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796338.1`	Pfam	`PF00083`	Sugar_tr	Family	28	490	2.1e-134	449.5	Sugar (and other) transporter
`XP_057796338.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	78	436	4.3e-26	92.4	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940355.1
CTAAATGACAGCTAAAATCTACTCATTCACATCGATACATACATAAACACAACACCATTGTAAGTCAACACTTTCTCTATATATACTACTCCCATCCCCTGCCTTCTTCCCCTACATTTCCTTCTCCCTCCGTCACTCCCATTCTCAAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTACATTCATCCTTCTCTTTCGAAAAAAATGGCGGGAGGTGGTTTCGGCCCCGGCCCCGGCGACGGCAAGCAATACCCCGGCAACCTAACGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012400
ATGGCGGGAGGTGGTTTCGGCCCCGGCCCCGGCGACGGCAAGCAATACCCCGGCAACCTAACGCCGTACGTGGTGGTGACCTGCATCATCGCCGCCATGGGCGGCCTCATATTCGGCTACGACATCGGAATCTCAGGTGGGGTGACGTCGATGGACTCGTTCCTGAAGAAATTCTTCCCGTCGGTGTACAGGAAGCAGAAGGCGGACGACTCCACCAACCAGTACTGCAAATTCGACAGCCAAACGCTCACCATGTTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796338.1
MAGGGFGPGPGDGKQYPGNLTPYVVVTCIIAAMGGLIFGYDIGISGGVTSMDSFLKKFFPSVYRKQKADDSTNQYCKFDSQTLTMFTSSLYLAALCSSLVASTVTRKLGRKLSMLCGGILFCVGALINGFAQAVWMLIVGRIFLGFGIGFANQSVPLYLSEMAPYKFRGALNIGFQLSITIGILAANVLNYGFAKIKGGWGWRLSLGGAMVPALIITVGSLILPETPNSMIERGQTEKARSKLKRIRGIDNVEEEFNDLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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