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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002225`

染色体: Chr02 坐标: 39567398-39569672 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002225`
名称	SmilChr02G002225
描述	uncharacterized SmilChr02G002225
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39567398 - 39569672 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012403`
GeneID	`131012403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012403`
原始查询	`SmilChr02G002225`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842429]; symbol=AT1G61350; hit=AT1G61350; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842429]; symbol=AT1G61350; hit=AT1G61350; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G61350` (AT1G61350) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842429] identity=49.4; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0560300` - identity=45.5; qcov=1.02; evalue=9.6e-153; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF23005 (DUF7032)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057796339.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057796339.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796339.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057796339.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796339.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39567601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C41
`Chr2:39567628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:39568015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B80,C61
`Chr2:39568104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C43,C53
`Chr2:39568118`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D8
`Chr2:39568118`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D8
`Chr2:39568276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B59,D2
`Chr2:39568315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B59,D2
`Chr2:39568335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr2:39568408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:39568528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B72,C8
`Chr2:39568531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B20,B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796339.1

572 aa

286

572

DUF7032

PF23005 DUF7032 21-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796339.1`	Pfam	`PF23005`	DUF7032	Domain	21	128	2e-34	118.5	Domain of unknown function (DUF7032)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940356.1
TTTATTTTTAGATATCGTTGAAAACTTGAAAAAAAAAAAATTAGGAAGAAATCGTGAAAGCAACTTTCTTGAATATTAGCTCTTATATGAAATTAAAAATTTCGACGTCCCAACTGAATAGACTCCTAGTCGAAGCTAAATTACCAAGACAACCCCTACATAGACTTGATGCTTCGCAAATAATCGTGCCCATTTTCGTAAAATTGGGCACAAATTGCGGTTCTATCCCAAGCCGTATTACAATAGACCTAGTCCCGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012403
ATGGGCGACGAAGAAATCGCCTCGTCATCGTCATCTACAACAGAAAAGCAACAATTACAGCAGGCAATTCTGCAAATTTCTTCGTTAATTTCCCTCTCCCACTCGATTAAAGTGTTCACGGCGAAATGGCAGTCGGCGAGGAGCAAGCTCGAGGAACTGATCTCGAACCTCGCCGCCATCGAGAACTGCGAATTGAGCGGGAATCCGTCGCTGTCGGAGGCGCTGGAGAAGATTCTAAGCACACTCACAAACTGCGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796339.1
MGDEEIASSSSSTTEKQQLQQAILQISSLISLSHSIKVFTAKWQSARSKLEELISNLAAIENCELSGNPSLSEALEKILSTLTNCDGLARRCSESSYSGKLLMQSDLDMLSAKLDAHITSFREIYSAGLLEQSHALVVSRPAASASKDDVRFYLNDVVSRLKIGSKTMKREALIALNQVIREDDRYVKIGAEIEGFLSILVNLLDFQDTEVQEEAARAVCLIAGFPPCKAELIAAGAIAPLIRVVESGSEPSKEFAARCL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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