当前解析结果
SmilChr02G002227| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002227 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002227 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002227 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 39619583 - 39620615 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012405 |
|---|---|
| GeneID | 131012405 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012405 |
| 原始查询 | SmilChr02G002227 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012405 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796341.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057796341.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796341.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057796341.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057796341.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:39619990 |
T |
TTG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | A4,B99 |
Chr2:39619990 |
T |
TTG |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | A4,B99 |
Chr2:39620087 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 14 | A16,B1,B109,B68,B75,B78,B90,B98,C20,C30,C34,C81,D10,D6 |
Chr2:39620095 |
CAT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 9 | B109,B68,B75,B78,B90,C20,C34,D10,D6 |
Chr2:39620098 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A16,B1,B98,C30 |
Chr2:39620102 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 9 | B109,B75,B78,B90,C20,C34,C81,D10,D6 |
Chr2:39620130 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B73,B82,B84,C33,C76 |
Chr2:39620234 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B33,B78 |
Chr2:39620278 |
GGA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C14 |
Chr2:39620278 |
GGA |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | C14 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。