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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002229`

染色体: Chr02 坐标: 39638466-39642509 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002229`
名称	SmilChr02G002229
描述	uncharacterized SmilChr02G002229
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39638466 - 39642509 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012408`
GeneID	`131012408`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012408`
原始查询	`SmilChr02G002229`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0636000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os04g0636000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0636000` - identity=73.3; qcov=0.512; evalue=1.8e-94; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13671 (AAA_33)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012408

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796344.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796344.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057796344.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796344.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796344.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39638838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,B84,C33,D10
`Chr2:39638984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,D2
`Chr2:39638986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:39639036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B62,C2,C32,C68
`Chr2:39639042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B83,C85
`Chr2:39639141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:39639369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:39639765`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B59,B67,C1,C59
`Chr2:39639765`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B59,B67,C1,C59
`Chr2:39640292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C48
`Chr2:39640383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796344.1

374 aa

187

374

AAA_33

PF13671 AAA_33 13-158 aa

XP_057796345.1

373 aa

186

373

AAA_33

PF13671 AAA_33 13-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796344.1`	Pfam	`PF13671`	AAA_33	Domain	13	158	6.6e-26	92.1	AAA domain
`XP_057796345.1`	Pfam	`PF13671`	AAA_33	Domain	13	158	6.5e-26	92.1	AAA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940362.1
AAGCTATGCTCATAAAAAGTGAATAGTAGTATAACTTTGAATCGAGTTCCTAGGTAAGTTGGTGATTGCAATCCTCTGCAGTATGTCATCCTCCAGTTATGTATTTTTTCACTAGCTAAAGTCGAAGGTATAAAGGCCGCGGCAAAGAGCCATCATTTACGTCCGCGCGCGAACACACACACAGTGAAAAATGGCGTCGAAACGCGAGTTGCCGTTGTGCGACGAGCCACTGCTGAAGAAGGCGAGAATTGCTGAATCGG...

XM_057940361.1
CTATGCTCATAAAAAGTGAATAGTAGTATAACTTTGAATCGAGTTCCTAGGTAAGTTGGTGATTGCAATCCTCTGCAGTATGTCATCCTCCAGTTATGTATTTTTTCACTAGCTAAAGTCGAAGGTATAAAGGCCGCGGCAAAGAGCCATCATTTACGTCCGCGCGCGAACACACACACAGTGAAAAATGGCGTCGAAACGCGAGTTGCCGTTGTGCGACGAGCCACTGCTGAAGAAGGCGAGAATTGCTGAATCGGAGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012408
ATGGGACCTGCCTTTGCTGATGAAAGTGAATGCGAAGTGATAATGATGGTGGGTTTACCAGCTTCTGGAAAAAGTACATGGGCTGAGAAGTGGGTGAATGAACATCCTGAAAAGCGGTATATTCTTCTTGGGACAAATTTAGCTTTGGAACAAATGAAGGTGCCTGGCTTGTTGCGCAAGCATAACTACAGTGAACGGTTTGACCGCTTGATGGATCGTGCCACCAAGATTTTTAATGCCCTTCTGTCAAGGGCTTCCAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796344.1
MGPAFADESECEVIMMVGLPASGKSTWAEKWVNEHPEKRYILLGTNLALEQMKVPGLLRKHNYSERFDRLMDRATKIFNALLSRASTIRRNFVIDQTNVYKSARRRKLKPFAYYIKIAAVVFPTAEELKSRAEKRLKEMGKEVPAEAVNQMLANFTLPMSKDMPGADEYFDQVWFVELNRAEAQRSLDEMKREASVLMSYNSSSLQHRENAPDQSYIGTSFQNQGKYAVSYGTSVSTPAYGNYPSEMQHGGFHPQPSALR...

XP_057796345.1
MGPAFADESECEVIMMVGLPASGKSTWAEKWVNEHPEKRYILLGTNLALEQMKVPGLLRKHNYSERFDRLMDRATKIFNALLSRASTIRRNFVIDQTNVYKSARRRKLKPFAYYIKIAAVVFPTAEELKSRAEKRLKEMGKEVPAEAVNQMLANFTLPMSKDMPGADEYFDQVWFVELNRAEAQRSLDEMKREASVLMSYNSSSLQHRENAPDQSYIGTSFQNQGKYVSYGTSVSTPAYGNYPSEMQHGGFHPQPSALRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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