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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002241`

染色体: Chr02 坐标: 39758522-39774632 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002241`
名称	SmilChr02G002241
描述	anaphase-promoting complex subunit 4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	39758522 - 39774632 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012419`
GeneID	`131012419`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012419`
原始查询	`SmilChr02G002241`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	anaphase-promoting complex subunit 4
产物	anaphase-promoting complex subunit 4
Arabidopsis	`AT4G21530` (APC4) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828238] identity=62.5; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0785900` (APC4) - identity=76.9; qcov=0.135; evalue=3.37e-54; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005680 (anaphase-promoting complex); GO:0031145 (anaphase-promoting complex-dependent catabolic process); GO:0034399 (nuclear periphery); GO:0045842 (positive regulation of mitotic metaphase/anaphase transition); GO:0070979 (protein K11-linked ubiquitination)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF12894 (ANAPC4_WD40); PF12896 (ANAPC4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012419

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057796354.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796354.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057796354.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057796354.1`
5	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.20000	`XP_057796354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:39760784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B95,C14
`Chr2:39760811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B127,C30
`Chr2:39760815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C7,C71
`Chr2:39761572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:39761655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:39763199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B83,C85
`Chr2:39763701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:39764148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B83,C85
`Chr2:39769789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C5,C72
`Chr2:39769825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr2:39769835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:39772079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B32,B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796354.1

770 aa

385

770

ANAPC4_WD40

ANAPC4

PF12894 ANAPC4_WD40 28-113 aa PF12896 ANAPC4 266-468 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796354.1`	Pfam	`PF12894`	ANAPC4_WD40	Repeat	28	113	1.4e-28	99.6	Anaphase-promoting complex subunit 4 WD40 domain
`XP_057796354.1`	Pfam	`PF12896`	ANAPC4	Domain	266	468	2.5e-54	184.6	Anaphase-promoting complex, cyclosome, subunit 4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940371.1
TTCAATGTTTCGAGTTAAAAAATCATAAGAAAAGAGCCCGCCTCTCAACTCTTTCCGTCACTCTCAAAACTCTGCAATTCTTTGCCTCGAATCAATCCATGGAAACCGACGAATCTCAAAGAGTAGTTCCGTTTCAGCTTCAATTCGACAAACCTATCGCTTCCCAGATTAAAATTGCTGAATGGAACCCGGAGAAGGATTTACTGGCAATGGTGACTGAGGATTCGAAGCTTCTTCTCCATCGCTTCAATTGGCAGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012419
ATGGAAACCGACGAATCTCAAAGAGTAGTTCCGTTTCAGCTTCAATTCGACAAACCTATCGCTTCCCAGATTAAAATTGCTGAATGGAACCCGGAGAAGGATTTACTGGCAATGGTGACTGAGGATTCGAAGCTTCTTCTCCATCGCTTCAATTGGCAGCGTCTATGGACGACATCCCCTGGGAAATGCATAACATCCATATGTTGGCGCCCGGATGGTAAAGCAATTGCAGTGGGCCTTGAAGACGGGACTATGTCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796354.1
METDESQRVVPFQLQFDKPIASQIKIAEWNPEKDLLAMVTEDSKLLLHRFNWQRLWTTSPGKCITSICWRPDGKAIAVGLEDGTMSLHDVENGKLLRSMKFHCASVVCLNWVEDRKKTMDGSNGNSTYEDRTARFFPPAPRVPRTAGLVPGDSSGFTDDSDDSFRELFDSSRQQFDILCSGDKDGNIYFNIFGIFPIGKVNIRDISFQSPLVGNRGSFQLMDASIRKMALSSDICHITVLCSGVLTETGSRSRDNQLSGC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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