当前解析结果
SmilChr02G002249| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002249 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002249 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002249 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 39928253 - 39929648 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131011196 |
|---|---|
| GeneID | 131011196 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131011196 |
| 原始查询 | SmilChr02G002249 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131011196 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057794974.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057794974.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057794974.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057794974.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057794974.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:39929003 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B103 |
Chr2:39929023 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,B104,B98,C27,C74 |
Chr2:39929025 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 7 | B126,B20,B22,B38,C14,C66,C67 |
Chr2:39929040 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B122,B33,C39,C63,D10 |
Chr2:39929061 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A15,C16,C20,C36 |
Chr2:39929065 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B126,B38,C66,C70 |
Chr2:39929071 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B101,C14 |
Chr2:39929094 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A4,B112,B74 |
Chr2:39929104 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr2:39929115 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,B36 |
Chr2:39929129 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,C23 |
Chr2:39929140 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | C28,C64,C66 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。