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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002273`

染色体: Chr02 坐标: 40197512-40198624 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002273`
名称	SmilChr02G002273
描述	CASP-like protein 1C1
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40197512 - 40198624 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013413`
GeneID	`131013413`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013413`
原始查询	`SmilChr02G002273`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 1C1
产物	CASP-like protein 1C1
Arabidopsis	`AT1G03700` (AT1G03700) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839428] identity=46.3; qcov=0.994; evalue=1.4e-53; confidence=high
Rice	`Os05g0245300` (OsBLE3) - identity=39.5; qcov=0.963; evalue=2.53e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013413

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797470.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797470.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797470.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797470.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797470.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40198228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr2:40198367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B137,C62,D10,D8
`Chr2:40198406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797470.1

163 aa

163

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 7-143 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797470.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	7	143	2.3e-37	128.8	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941487.1
AATTTTCCATCACCAACTGGTAGTTGGTGAAGGTCAGAACTGGCAGAAAGATATTTGGGGCAGTCATTAGGTTACCAAGAAGATGGGAAGCAAAGACAAAGCTCATCTGCCTTTTCCTAACACAACCATGTATTCTTTTATTTCCCTAAATTTTTACACATTTATATGAAACTTGTAATTTCATCTCCACACAAAAAATGATGAGTTTATCAAAGAGAATTCCAATGCTTGTGCTGAGGCTTGTAGCCTTGGGAGCAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013413
ATGATGAGTTTATCAAAGAGAATTCCAATGCTTGTGCTGAGGCTTGTAGCCTTGGGAGCAAGTGTTAGTGCTATAGTGATAATGGTGAGCAGCCATGACTCTGCTCAGCTCTTCAGTATGAAGTTCGACGCCAAATACTCCCACACCCCAACCTTCAAATACTTTGTGTTGGTGAATGGTATTGCAAGTGGCTACACATTCATACTGCTGTTTTTCCCTTCCAAGAGTTCGTGCGCCCACATCATCTTGCTTCTTGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797470.1
MMSLSKRIPMLVLRLVALGASVSAIVIMVSSHDSAQLFSMKFDAKYSHTPTFKYFVLVNGIASGYTFILLFFPSKSSCAHIILLLDLMMALVLDSSISACVAIGQVGKKGNSHAGWLPICGQVPKFCDHVTGAIAAGFIAAIAYFLVLLYSLHNVMNLFALRA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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