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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002275`

染色体: Chr02 坐标: 40209758-40210600 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002275`
名称	SmilChr02G002275
描述	uncharacterized SmilChr02G002275
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40209758 - 40210600 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008445`
GeneID	`131008445`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008445`
原始查询	`SmilChr02G002275`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=29; qcov=1.04; evalue=9.49e-24; confidence=low
Rice	`Os03g0158600` - identity=25.6; qcov=0.489; evalue=3.42e-08; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008445

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791307.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057791307.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791307.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057791307.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40209765`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	90	A18,A21,A23,A25,B10,B101,B102,B103,B105,B107,B112,B113,B115,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B126,B127,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B138,B14,B23,B26,B27,B33,B34,B4,B42,B43,B46,B48,B49,B5,B50,B53,B54,B55,B56,B60,B64,B68,B70,B73,B74,B75,B77,B79,B80,B87,B9,B90,B92,B94,B96,B98,C1,C17,C18,C21,C3,C38,C39,C41,C45,C49,C54,C56,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C73,C74,C76,C8,C80,C9,D4,D8,D9
`Chr2:40209823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B63
`Chr2:40209823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr2:40209827`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	40	A1,A11,A13,A15,A23,A4,B105,B106,B11,B113,B117,B129,B130,B135,B19,B35,B37,B41,B45,B47,B55,B62,B66,B69,B73,B77,B81,B91,B95,C13,C14,C27,C31,C65,C76,C81,C83,D10,D11,D3
`Chr2:40209835`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B113,B120,B131,B137,B21,B35,B41,B53,C47,C57,C60,C77,D1
`Chr2:40209843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,C16,C60,C61
`Chr2:40209844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:40209854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B87,C42
`Chr2:40209865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B30,C37,C4,C74
`Chr2:40209907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:40209943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr2:40210007`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A21,B100,B111,B114,B120,B13,B134,B3,B34,B44,B7,B78,B93,C11,C20,C22,C34,C36,C4,C40,C47,C69,C70,C9,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791307.1

280 aa

140

280

RVT_3

PF13456 RVT_3 148-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791307.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	148	267	1.3e-12	48.4	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935324.1
ATGGCGCGTGGTTTGCAAGTGGGAGGTGAGTGTGGCGTTTGTAAAGAGGGCTTTGAAAACCTTTGGCACGTTTTTTTTGCTTGCCCGTTTGCGGAGCTTTGTTGGGAGGTTGGTGATTTTTCGATTTTACTGGCCTATGTTAGGGTGAACTGTGAATCTTTTAAGGAAGCTATCTCATATATTATGGATATGGCTGATGGGGAGCTGACTGCCAAAGTGTGCATGATTTTGTGGCATATCTGGAAGGATCGGAATAAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008445
ATGGCGCGTGGTTTGCAAGTGGGAGGTGAGTGTGGCGTTTGTAAAGAGGGCTTTGAAAACCTTTGGCACGTTTTTTTTGCTTGCCCGTTTGCGGAGCTTTGTTGGGAGGTTGGTGATTTTTCGATTTTACTGGCCTATGTTAGGGTGAACTGTGAATCTTTTAAGGAAGCTATCTCATATATTATGGATATGGCTGATGGGGAGCTGACTGCCAAAGTGTGCATGATTTTGTGGCATATCTGGAAGGATCGGAATAAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791307.1
MARGLQVGGECGVCKEGFENLWHVFFACPFAELCWEVGDFSILLAYVRVNCESFKEAISYIMDMADGELTAKVCMILWHIWKDRNKAVWEETIPVPRRTVALAISCREKWLGARASQLNMVSPTAVPSATLSCAGWHAVPTGWVRYGVDAAFFGNDNSMGIGIVIRNHMGEFVVGKTMKVVGRRDVVEGELMGVKEALSWLKSLGYLQGWVECDSKVACDAISKNLGIINERGVLANFCRRELASNPGIRLCNVCRSRNA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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