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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002278`

染色体: Chr02 坐标: 40268467-40269588 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002278`
名称	SmilChr02G002278
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40268467 - 40269588 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008447`
GeneID	`131008447`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008447`
原始查询	`SmilChr02G002278`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 3-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 3-like
Arabidopsis	`AT2G27110` (FRS3) FAR1-related sequence 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817253] identity=27.3; qcov=0.697; evalue=2.82e-22; confidence=low
Rice	`Os04g0354200` - identity=25.7; qcov=0.657; evalue=9.15e-20; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008447

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791308.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057791308.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791308.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791308.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791308.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40268477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C13
`Chr2:40268488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:40268490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:40268494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:40268505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,D7
`Chr2:40268532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,C48,C78,C85,C87
`Chr2:40268566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B32
`Chr2:40268575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B32
`Chr2:40268588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C7,C71
`Chr2:40268652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B36,B41,B51
`Chr2:40268657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B1,B69
`Chr2:40268657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791308.1

373 aa

186

373

SWIM

PF04434 SWIM 201-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791308.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	201	223	0.00019	21.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935325.1
ATGAAGGTTGCCGAGAAGTTACCGAATCACTTAAGGAACGTCTCCGAGCTAAAAGACAGATTCAACAATATTGTGTGGTCTGATCTTGTTGAACCTTCTGTCTTTGAGGAGAATTGTCACCGTCTCATGGATGATTATGACCTTAGAGACAATAGATGGTTCATAGACATGTTTGCCTTAAGAGCCAATTGGGTTCCTGCATATTTTCGAGACATTAAGATCAGTGGGCTCTTCAAGACAACCTCAATGTCCAAGAGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008447
ATGAAGGTTGCCGAGAAGTTACCGAATCACTTAAGGAACGTCTCCGAGCTAAAAGACAGATTCAACAATATTGTGTGGTCTGATCTTGTTGAACCTTCTGTCTTTGAGGAGAATTGTCACCGTCTCATGGATGATTATGACCTTAGAGACAATAGATGGTTCATAGACATGTTTGCCTTAAGAGCCAATTGGGTTCCTGCATATTTTCGAGACATTAAGATCAGTGGGCTCTTCAAGACAACCTCAATGTCCAAGAGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791308.1
MKVAEKLPNHLRNVSELKDRFNNIVWSDLVEPSVFEENCHRLMDDYDLRDNRWFIDMFALRANWVPAYFRDIKISGLFKTTSMSKSENSFFRRHLNQNADLVQLYMYYVGAMEAQCSTYDTITLADETGSLNLFTQFPIEHHASTVYTNKIFKENVQVEIVSVAATCLISQMYVENSINFYEVDDTVDGVSKVCYSSVDDEYTCSCKLFIRKALMCRHIFFVMRTMKLTRIPNKYIAARWSKLSRVVAPPAEHVAPSDST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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