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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002285`

染色体: Chr02 坐标: 40318377-40322014 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002285`
名称	SmilChr02G002285
描述	protein GID8 homolog
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40318377 - 40322014 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013408`
GeneID	`131013408`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013408`
原始查询	`SmilChr02G002285`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GID8 homolog
产物	protein GID8 homolog
Arabidopsis	`AT1G61150` (AT1G61150) LisH and RanBPM domains containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842408] identity=81.7; qcov=0.996; evalue=2.92e-139; confidence=high
Rice	`Os03g0235100` - identity=77.2; qcov=1.02; evalue=2.42e-140; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0043161 (proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF08513 (LisH); PF10607 (CTLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013408

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797465.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797466.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057797465.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057797465.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057797466.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40318700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B36,B41,B51
`Chr2:40319904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:40319917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr2:40319943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:40319944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr2:40320207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C5
`Chr2:40320235`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	B117,B118,B121,B125,B127,B14,B17,B18,B28,B4,B43,B46,B52,B6,B61,B63,B64,B65,B67,B72,B78,B79,B8,B81,B89,B91,B99,C10,C12,C22,C30,C4,C50,C54,C55,C60,C62,C69,C78,C9,D11,D2,D3
`Chr2:40320258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D3,D5
`Chr2:40320287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C85
`Chr2:40320292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B83
`Chr2:40320294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B117,B39,B6,B66,B81,B99,C12,C54,D3
`Chr2:40320522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B73,C31,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797465.1

252 aa

126

252

LisH

CTLH

PF08513 LisH 51-77 aa PF10607 CTLH 88-230 aa

XP_057797466.1

242 aa

121

242

LisH

CTLH

PF08513 LisH 41-67 aa PF10607 CTLH 78-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797465.1`	Pfam	`PF08513`	LisH	Domain	51	77	1.2e-08	35.3	LisH
`XP_057797465.1`	Pfam	`PF10607`	CTLH	Domain	88	230	3.5e-35	122.0	CTLH/CRA C-terminal to LisH motif domain
`XP_057797466.1`	Pfam	`PF08513`	LisH	Domain	41	67	1.1e-08	35.4	LisH
`XP_057797466.1`	Pfam	`PF10607`	CTLH	Domain	78	220	3e-35	122.1	CTLH/CRA C-terminal to LisH motif domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941483.1
GGATACACTGGTAATAAACCTTGGTTTACTTGAACATCATATTACGTGTGTGTGTGGGTTTTTAATAGTTGAGTTGTATTTTACAGTGCTTTAATCACACAAAAATGGCGTCAACCATTGTAGATGGTCGTAGCAGATAGCAGTATTTTTTTCAATCAATTTACAGCCCCCCCCCCCCCCTTTTTTTTTTGAGGAGGCAATCAATTTACAGCCTTGTTTCTTGTTTTCTAGACAAAATATTGACTAAAATAGTTACAGTA...

XM_057941482.1
CTCTCCATCTCTCTCCTCGCCCAAAGAAAATTGAATTTCTCTAATTGTAAAAGAATCACATTTCGTTTGATAAATTATTTGGGTTTAATATGTGCTCCTTGTTAATCAAAATTTCTACGTTTTATTCATATGATGTTCGATTTCGTTATGGGCTTGTAATACGCTTCAGGGCTACATCGAAGAAAGTTATAACCAGAGTAGAGTGGGAGAAAAAACTCAAGGATGTTAAAGTTAGAAAAGACGATATGAATAAATTGGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013408
ATGTCATTGTTTTGGATTGTCATTCGCGAACTCGCTGAAATCCAAGCTATGGCTACATCGAAGAAAGTTATAACCAGAGTAGAGTGGGAGAAAAAACTCAAGGATGTTAAAGTTAGAAAAGACGATATGAATAAATTGGTTATGAACTTTCTGGTTACTGAGGGTTACGTGGAAGCTGCTGAAAAATTTAGACTTGAATCTGGGACAGAGCCGGACATAGATCTTGCAACCATTACTGATCGTATGGCAGTTAAGAAAGC...

LOC131013408
ATGTGCTCCTTGTTAATCAAAATTTCTACGTTTTATTCATATGATGTTCGATTTCGTTATGGGCTTGTAATACGCTTCAGGGCTACATCGAAGAAAGTTATAACCAGAGTAGAGTGGGAGAAAAAACTCAAGGATGTTAAAGTTAGAAAAGACGATATGAATAAATTGGTTATGAACTTTCTGGTTACTGAGGGTTACGTGGAAGCTGCTGAAAAATTTAGACTTGAATCTGGGACAGAGCCGGACATAGATCTTGCAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797465.1
MCSLLIKISTFYSYDVRFRYGLVIRFRATSKKVITRVEWEKKLKDVKVRKDDMNKLVMNFLVTEGYVEAAEKFRLESGTEPDIDLATITDRMAVKKAVQSGNVEDAIEKVNDLNPEILDTNPQLFFHLQQQRMIELIRNGKVEAALEFAQEELAPRGEENQGFLEELERTVALLAFEDVANCPVGELLDISQRLKTASEVNAAILTSQSHEKDPKLPSLLKMLIRVQNQLDEKASYPRIIDLSTAALEDPVV

XP_057797466.1
MSLFWIVIRELAEIQAMATSKKVITRVEWEKKLKDVKVRKDDMNKLVMNFLVTEGYVEAAEKFRLESGTEPDIDLATITDRMAVKKAVQSGNVEDAIEKVNDLNPEILDTNPQLFFHLQQQRMIELIRNGKVEAALEFAQEELAPRGEENQGFLEELERTVALLAFEDVANCPVGELLDISQRLKTASEVNAAILTSQSHEKDPKLPSLLKMLIRVQNQLDEKASYPRIIDLSTAALEDPVV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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