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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002286`

染色体: Chr02 坐标: 40388840-40390754 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002286`
名称	SmilChr02G002286
描述	probable 2' cyclic ADP-D-ribose synthase BdTIR
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40388840 - 40390754 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013415`
GeneID	`131013415`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013415`
原始查询	`SmilChr02G002286`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable 2' cyclic ADP-D-ribose synthase BdTIR
产物	probable 2' cyclic ADP-D-ribose synthase BdTIR
Arabidopsis	`AT1G61105` (AT1G61105) Toll-Interleukin-Resistance (TIR) domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745840] identity=65.4; qcov=0.839; evalue=2.07e-73; confidence=high
Rice	`Os07g0566800` (OJ1092_A07.109) - identity=51.1; qcov=0.731; evalue=6.64e-45; confidence=medium
GO	GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF01582 (TIR); PF13676 (TIR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013415

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797472.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057797472.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057797472.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797472.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40389220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr2:40389258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr2:40389260`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C53
`Chr2:40389260`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C53
`Chr2:40389261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B69
`Chr2:40389263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr2:40389315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B30,B7,D11
`Chr2:40389345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,B76,D8
`Chr2:40389411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C86
`Chr2:40389433`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B37
`Chr2:40389433`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B37
`Chr2:40389483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797472.1

193 aa

193

TIR

TIR_2

PF01582 TIR 28-126 aa PF13676 TIR_2 29-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797472.1`	Pfam	`PF01582`	TIR	Domain	28	126	2.9e-14	54.0	TIR domain
`XP_057797472.1`	Pfam	`PF13676`	TIR_2	Domain	29	121	1.8e-14	55.0	TIR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941489.1
GAGAGTCGAATCGTTCAAATGAAATCTTGGCCCATTTTTTCTCCAATATTCCCCAGTATTTTCAAGAGTCCAAACCACGGTTTTCAAGAGTCAAACTCGTCAAATAAACCTATATATAAACACACCCTACGTCGCTTAATTATCTAGTAGTACAACACTAAATTAAACTTTGCCAAAAAAGAAAAGAAAAGAATTTCAATAAACAAAGTACCAAATACTACACATATCCAACAATAATAATAACCCCTATTTTTGGCATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013415
ATGCAACGTTCATACTCCGCCAGATTCAAAGCCATCTCCGGCCAACTCAGGCGCGGCCGCGGGAGCCAGGAGGCGCCCTGCGATGTGTTCATCAACCACCGTGGGGTGGACACAAAGCGGAATGTGGCAGGGCTCCTCTACTACCACCTCCTCGGCCTCCGCCTCCGGCCATTCTTGGACAGCAAGAGCATGAAGCCCGGCGAAAAGCTCTCCGAGAAGATCCCTGCAGCCATACAGGGATGCAAGGTCGGGGTGGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797472.1
MQRSYSARFKAISGQLRRGRGSQEAPCDVFINHRGVDTKRNVAGLLYYHLLGLRLRPFLDSKSMKPGEKLSEKIPAAIQGCKVGVAVFSPMYCDSYFCLHELSLMVEREKRVVPIFCDVKPSELRVKDDGSCPGSELHRFRSALEDAKCTVGLTFDTIRGDWSEFLESAGDTVIKNLIEVDEESINDITQKLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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