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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002293`

染色体: Chr02 坐标: 40461289-40463545 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002293`
名称	SmilChr02G002293
描述	sphingolipid delta(4)-desaturase DES1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40461289 - 40463545 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013404`
GeneID	`131013404`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013404`
原始查询	`SmilChr02G002293`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sphingolipid delta(4)-desaturase DES1-like
产物	sphingolipid delta(4)-desaturase DES1-like
Arabidopsis	`AT4G04930` (DES-1-LIKE) fatty acid desaturase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825832] identity=81.5; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0639600` - identity=82.7; qcov=0.969; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0042284 (sphingolipid delta-4 desaturase activity); GO:0046513 (ceramide biosynthetic process)
KEGG	smil00600 (Sphingolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00487 (FA_desaturase); PF08557 (Lipid_DES)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013404

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057797462.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057797462.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797462.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797462.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797462.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40462012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr2:40462102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr2:40462104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr2:40462174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797462.1

327 aa

164

327

Lipid_DES

FA_desaturase

PF08557 Lipid_DES 11-45 aa PF00487 FA_desaturase 69-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797462.1`	Pfam	`PF08557`	Lipid_DES	Domain	11	45	7.6e-20	70.8	Sphingolipid Delta4-desaturase (DES)
`XP_057797462.1`	Pfam	`PF00487`	FA_desaturase	Domain	69	292	1.1e-26	94.8	Fatty acid desaturase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941479.1
GAGCCCAAGTTTAAACATCATTTAAAATTCTCACAAAATAGAAAGAGACCTAAATGTGAATTGCTCAATTGCTTTATTAGGATTAGGATATTCATCCATCTCAACAAAGAATGAGCTCCATGTGCAACTGCAATGAGGAATGCTGTTAATCTCCAATTTATCCATCGCATCAAGACAAGAAGATTCACAGACAACGCAAATCTAGCAGGGACAAAAGTAGAAAAATACACCCTCGTTTCATTCAAATTGAAAAGGCACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013404
ATGGGGTTTGAAGGGAAAGAGGGAGTAATGGCTACTGATTTTTTCTGGTCCTATACTGACGAGCCGCATGCTTCCCGCAGGAGGCAGATCCTCTCTCAATATCCTCAAATCAAACAATTGTTTGGTCCTGATCCCTTCGCTTTCCTTAAGATTTCTGCAGTTGTGCTGCTTCAGCTATGGACTGCGACTTTCCTAAACAACGCATCCTGGGTGAAGATACTTATAGTGGCGTATTTCTTCGGCTCTTTCCTCAACCACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797462.1
MGFEGKEGVMATDFFWSYTDEPHASRRRQILSQYPQIKQLFGPDPFAFLKISAVVLLQLWTATFLNNASWVKILIVAYFFGSFLNHNLFLAIHELSHNLAFSTPVYNRWLGIFANLPIGVPMSVTFQKYHLEHHRYQGVDGVDMDVPSLTEAKVVRNTISKSIWVVLQLFFYAFRPLFLKPKPPGIWEFINLTIQLALDAAVVCFFGWKSLGYLILSTFVGGGMHPMAGHFISEHYVFNPDQETYSYYGPLNLMTWSVGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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