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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002295`

染色体: Chr02 坐标: 40470118-40472149 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002295`
名称	SmilChr02G002295
描述	glutathione S-transferase T2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40470118 - 40472149 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008453`
GeneID	`131008453`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008453`
原始查询	`SmilChr02G002295`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase T2-like
产物	glutathione S-transferase T2-like
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=40.8; qcov=0.342; evalue=1.95e-23; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=53.3; qcov=0.498; evalue=2.07e-50; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008453

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791312.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791312.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791312.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791312.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791312.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40470137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:40470196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr2:40470196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:40470209`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A22,A9,B101,B11,B110,B113,B131,B135,B138,B17,B22,B24,B28,B35,B5,B50,B67,B76,B80,B91,B95,B99,C24,C29,C30,C41,C44,C46,C48,C56,C66,C77,C83,C87,C9,D8
`Chr2:40470217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B104,C71,D4,D6
`Chr2:40470217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C71,D4,D6
`Chr2:40470220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B41,B84,C5
`Chr2:40470223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A10,A25,B107,B109,B118,B128,B130,B136,B61,B81,B84,C15,C29,C77,D4
`Chr2:40470244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C79,D11
`Chr2:40470273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B41
`Chr2:40470285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B41,C35,C43
`Chr2:40470311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B35,C37,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791312.1

301 aa

150

301

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 233-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791312.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	233	301	2.5e-29	103.1	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935329.1
ATGAAAGGCCGCTGGAAACGTCTTAACGAAAATGAAAACAAATGGGTTGCTGCTTGCAAGGAAGCAAATGCTCGAAGAAGGAGTGGAATGAGCGACGACGATGTTGAGAAAGAAGCTCATTCCATTTACGAAGCATATGTTGATAATCAGGAAAGTGGTGCCAGTTCGAAAAGATCAAAGACTTCGGAAGATGGGGGATTTTCAATCCCTTCTAATCCAGAAACTCCAACATCTAAACAGTCAACTGCGACTCGTCCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008453
ATGAAAGGCCGCTGGAAACGTCTTAACGAAAATGAAAACAAATGGGTTGCTGCTTGCAAGGAAGCAAATGCTCGAAGAAGGAGTGGAATGAGCGACGACGATGTTGAGAAAGAAGCTCATTCCATTTACGAAGCATATGTTGATAATCAGGAAAGTGGTGCCAGTTCGAAAAGATCAAAGACTTCGGAAGATGGGGGATTTTCAATCCCTTCTAATCCAGAAACTCCAACATCTAAACAGTCAACTGCGACTCGTCCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791312.1
MKGRWKRLNENENKWVAACKEANARRRSGMSDDDVEKEAHSIYEAYVDNQESGASSKRSKTSEDGGFSIPSNPETPTSKQSTATRPIGRDKAKRKGKELRAIRLTRDAEAELIKTRIELEREKLQRNTMNMKEKMLLQLLVKEHLSSEDKEMKQIAIQIVEAATANDEFFQQRRDATSRVGLSSLQKCTGAMWVLAYGTSSDVVDEYLRMSSSSTRDALVHFVEGVISCFGGTYLKRPNEQDLARLLYVGEQRGFPGMIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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