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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002301`

染色体: Chr02 坐标: 40603598-40605206 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002301`
名称	SmilChr02G002301
描述	uncharacterized SmilChr02G002301
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40603598 - 40605206 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013412`
GeneID	`131013412`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013412`
原始查询	`SmilChr02G002301`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	senescence-associated family protein (DUF581) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819075]; symbol=AT2G44670; hit=AT2G44670; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	senescence-associated family protein (DUF581) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819075]; symbol=AT2G44670; hit=AT2G44670; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G44670` (AT2G44670) senescence-associated family protein (DUF581) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819075] identity=51.4; qcov=0.561; evalue=1.06e-29; confidence=medium
Rice	`Os02g0687200` - identity=65.4; qcov=0.278; evalue=2.41e-20; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04570 (zf-FLZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013412

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797469.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797469.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797469.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797469.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797469.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40603736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B38
`Chr2:40603738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B38,B52
`Chr2:40603746`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	A10,A6,A8,B102,B119,B130,B36,B42,B43,B49,B6,B60,B84,B85,B87,C28,C3,C30,C6,C67,C81,C83,C87,D1,D6
`Chr2:40603763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:40603795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C9
`Chr2:40603795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr2:40603812`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B120,B51,B74,B95
`Chr2:40603818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B99,C26
`Chr2:40603826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,D11
`Chr2:40603862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:40603866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:40603868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B46,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797469.1

187 aa

187

zf-FLZ

PF04570 zf-FLZ 95-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797469.1`	Pfam	`PF04570`	zf-FLZ	Domain	95	141	2.6e-23	81.9	zinc-finger of the FCS-type, C2-C2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941486.1
AATACCGCCGCCGCTGGTCCGAAAATCAGCAAGAACTGCGCACAGCCCATCCACCACCTCTTGTTGGAGTTACCATGAACTGCTGCTGCTTCTCTCAGTTTTTTCTGAAGTTGCCGCCGCCATGGATATCCGGCGAGTTCAACCTCAACTTCTACCATGCTTCCGTCTCCAAGCTGTACGGAGTCTCTGTTATAGCTGCTCACCACTCGACACAAATGCCACCAACGGCTGCGGGAAATTCTGCTCAGATACGAAATGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013412
ATGCCAAGCAGAGAAACAAAAGAAATCCGCTCTCGCTCTCTCTCGGTTCACACAGGGACAGCCGCCGACCTTCTTCCCCGGTGGAAACAGCCGCCGGAGGGCCGCCTCCTCCGTTTCCCTCACCCTCTTCTCTATCTCTCTCACTCCGATCATCAACGGCCGCCGCGCCAACTGCAACCTCGCCGGCCACGGCGGCTGCCGCTGCACCTTCCCATCACCGTCGCCACCGCCGCTGCAACCATGGGCTCAGCCGCAGCATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797469.1
MPSRETKEIRSRSLSVHTGTAADLLPRWKQPPEGRLLRFPHPLLYLSHSDHQRPPRQLQPRRPRRLPLHLPITVATAAATMGSAAAYYYTGCEHDYQPHFLDSCSLCRRPLSQNSDIFMYRGNTPFCSQECRQEQIEMDEATGKKWKMSLSSSSSSSKRSSAVRQTSDSAKESDTNKVVQRGTVAVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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