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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002305`

染色体: Chr02 坐标: 40666821-40668280 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002305`
名称	SmilChr02G002305
描述	uncharacterized SmilChr02G002305
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40666821 - 40668280 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008455`
GeneID	`131008455`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008455`
原始查询	`SmilChr02G002305`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os06g0523701` - identity=36.1; qcov=0.474; evalue=1.31e-44; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF24964 (DUF7769)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008455

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791314.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057791314.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791314.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791314.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791314.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40666853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C51,C76
`Chr2:40666879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C62
`Chr2:40666891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,D5
`Chr2:40666898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B64,C20
`Chr2:40666898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C20
`Chr2:40666901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	95	A14,A2,A21,A22,A23,A24,A25,A5,A7,A8,B101,B102,B103,B106,B107,B110,B112,B113,B115,B119,B12,B121,B127,B128,B131,B132,B135,B14,B19,B23,B24,B27,B28,B40,B42,B45,B47,B48,B50,B51,B54,B58,B59,B61,B62,B65,B67,B72,B73,B76,B77,B80,B86,B87,B88,B94,B98,B99,C1,C10,C11,C14,C16,C18,C19,C23,C27,C3,C32,C33,C34,C43,C44,C45,C48,C49,C5,C56,C61,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C76,C78,C79,C8,C80,C83,C87,D2,D7,D9
`Chr2:40666947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B13,B77
`Chr2:40667054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A2,A24,B112,B118,B123,B126,B18,B28,B33,B34,B36,B37,B40,B5,B52,B91,B94,B98,C13,C15,C25,C36,C52,C6,C63,C67,C85,D5
`Chr2:40667087`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B129,B136,D5
`Chr2:40667087`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B129,B136,D5
`Chr2:40667104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D10
`Chr2:40667129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791314.1

456 aa

228

456

DUF7769

PF24964 DUF7769 10-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791314.1`	Pfam	`PF24964`	DUF7769	Domain	10	61	3.9e-09	36.7	Domain of unknown function (DUF7769)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935331.1
ATGGCAGACAAACGAAAAAAGGCCAACTTGACAGAAATTGAAAGAAACAACATTGCACAATGGCTTCTCCAAAACAACAAGGACTTCAAGCTTCGGTACGGCGCGAAGAAAGAGGCAGCAGCTATGTTCAACATCGATGTGAGGACGGTTTGGCGACTGTGGACAGCAGCACGCGCACAAAAAATGATGGGAAGACATGTACAACTCGTTTCAATGAAGAAGGGATCAACACATAGCGATAAAAAGGTAATCGACGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008455
ATGGCAGACAAACGAAAAAAGGCCAACTTGACAGAAATTGAAAGAAACAACATTGCACAATGGCTTCTCCAAAACAACAAGGACTTCAAGCTTCGGTACGGCGCGAAGAAAGAGGCAGCAGCTATGTTCAACATCGATGTGAGGACGGTTTGGCGACTGTGGACAGCAGCACGCGCACAAAAAATGATGGGAAGACATGTACAACTCGTTTCAATGAAGAAGGGATCAACACATAGCGATAAAAAGGTAATCGACGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791314.1
MADKRKKANLTEIERNNIAQWLLQNNKDFKLRYGAKKEAAAMFNIDVRTVWRLWTAARAQKMMGRHVQLVSMKKGSTHSDKKVIDVEKVKQLSVLERSTIRKMANKLEVSKSLVGVWIKEKKIRAHTNTIKPLLTQQNRLSRLTWSLSQLSAISANGRIKFQPMYNTIHIDEKWFYLTKTSDRYYLLPDEIEPYRACKSKRFIEKIMFICVVSRPQYDNEGKMIFDGKFGIFPFTTVVPAVRNNKNRLRGTLETKPIQAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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