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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002320`

染色体: Chr02 坐标: 40870833-40873277 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002320`
名称	SmilChr02G002320
描述	uncharacterized SmilChr02G002320
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40870833 - 40873277 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008460`
GeneID	`131008460`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008460`
原始查询	`SmilChr02G002320`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0142900` - identity=36.1; qcov=0.311; evalue=1.84e-26; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008460

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791319.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791319.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057791319.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791319.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791319.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40870855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B104,B122,B72,D10
`Chr2:40870857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B72,D1
`Chr2:40870864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B72,D3
`Chr2:40870874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:40870881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:40870899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:40870941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C19
`Chr2:40870968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:40870997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:40871160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A9,B42,B43,B59,B62
`Chr2:40871160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B42,B43,B59,B62
`Chr2:40871169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791319.1

615 aa

308

615

Asp_protease_2

RVT_1

PF13650 Asp_protease_2 130-220 aa PF00078 RVT_1 469-568 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791319.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	130	220	1.1e-06	29.9	Aspartyl protease
`XP_057791319.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	469	568	1.5e-17	64.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935336.1
ATGGAAGAGCAAGTAAAGGAGCCGCTGCAGCCAAGAGAGGAGGAGAAGGAGAAAGAGAAGGAGCCCGGAGTGAAGCTCCACAAGGCTACCAAGCCATATAAGCCACCGGTCCCCTATCCAAGCCGATTGAAGAATGAAAAGCTGGACCAACAGTTCACCGATTTCTACAACATGTTGGCAAAGGTGAACGTGAACCTGCCGTTGCTAGACGTGATCAGAAATGTCCCAGCCTACCTGAAGTTCTTTAAAGAGTTGGCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008460
ATGGAAGAGCAAGTAAAGGAGCCGCTGCAGCCAAGAGAGGAGGAGAAGGAGAAAGAGAAGGAGCCCGGAGTGAAGCTCCACAAGGCTACCAAGCCATATAAGCCACCGGTCCCCTATCCAAGCCGATTGAAGAATGAAAAGCTGGACCAACAGTTCACCGATTTCTACAACATGTTGGCAAAGGTGAACGTGAACCTGCCGTTGCTAGACGTGATCAGAAATGTCCCAGCCTACCTGAAGTTCTTTAAAGAGTTGGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791319.1
MEEQVKEPLQPREEEKEKEKEPGVKLHKATKPYKPPVPYPSRLKNEKLDQQFTDFYNMLAKVNVNLPLLDVIRNVPAYLKFFKELASKKRRFEDNEKILVSEVANSIMQQPLPTKQRDPGSFVINIALGNGKEASGMLDLGAGINLMPYSIFKQLELGNLKPTRMCLQLADRSVRYPHGVVEDILVRVGGLIVPVDFVVLEIGEVHENGKEHTLLLGRPFMATTNTLIDVKNGTIKMTVLGEPVSFSVHHNRAMPSSSLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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