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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002322`

染色体: Chr02 坐标: 40885050-40888334 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002322`
名称	SmilChr02G002322
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40885050 - 40888334 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013442`
GeneID	`131013442`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013442`
原始查询	`SmilChr02G002322`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D-like
Arabidopsis	`AT4G20980` (AT4G20980) Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 7 (eIF-3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827845] identity=74.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0566500` (eIF-3d) - identity=71; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005852 (eukaryotic translation initiation factor 3 complex); GO:0006413 (translational initiation)
KEGG	-
Pfam	PF05091 (eIF-3_zeta)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013442

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797507.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057797507.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797507.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797507.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797507.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40885261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:40885265`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A2,B38
`Chr2:40885265`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A2,B38
`Chr2:40885351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:40885639`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B86
`Chr2:40885639`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B86
`Chr2:40885720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B93,C2,C31,D1
`Chr2:40885823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr2:40886074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797507.1

583 aa

292

583

eIF-3_zeta

PF05091 eIF-3_zeta 5-530 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797507.1`	Pfam	`PF05091`	eIF-3_zeta	Family	5	530	1e-200	669.0	Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 7 (eIF-3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941524.1
CAAATCTATGCGCCCATAGAAACAGATAGCCCATTAAATACTATACAAAAACTCTCTTTCTCTTCTCTAAATAAATATTCTAACAACAGCCCAAACAACGCCTAGGGTTTTTATATACAAAAAAACCCTACTTCTCAGCTCAGTTTCACGCACATCACACAGCAGCAGCAATGGTAGGATTCGAAATCGGTGCCGTGCCTTTTAATCCCGACGGCTGGGGTCCACCTGATTCCGCTGCTGCCGGCCTCTCCGTCCCCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013442
ATGGTAGGATTCGAAATCGGTGCCGTGCCTTTTAATCCCGACGGCTGGGGTCCACCTGATTCCGCTGCTGCCGGCCTCTCCGTCCCCAACCACCCATCCAATGTCCCCTTCGCTCCCTTCTCCCGCTCCGAGAAATTGGGGCGAATCGCTGATTGGACCAGAAACATGAATAATTCGGGCCGCCCCGGATCCAAGCAGGGCGGCTACCACGCCGCCGATTCCGCCTTCGATTTCTCCGGCGATGACTCCTTCGCCACCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797507.1
MVGFEIGAVPFNPDGWGPPDSAAAGLSVPNHPSNVPFAPFSRSEKLGRIADWTRNMNNSGRPGSKQGGYHAADSAFDFSGDDSFATLAADEDSSFRLVDTSAKSHHHNPNRPKFNPRWRFNPHHARSQLPQRRDEEQEAKKREAEKERARRDRLYNANRSQMPQRRESSVFKSSVDIQPEWNMLDQIPFSTFSKLSYSVPEPEDLLICGGLEFYDRSYDRITPKNCRPLERFKSRNFFKVTTTDDPVIRRLANEDKATVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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