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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002324`

染色体: Chr02 坐标: 40920720-40921642 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002324`
名称	SmilChr02G002324
描述	uncharacterized SmilChr02G002324
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40920720 - 40921642 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008462`
GeneID	`131008462`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008462`
原始查询	`SmilChr02G002324`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=26.4; qcov=0.587; evalue=2.95e-11; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=31; qcov=1.15; evalue=1.46e-46; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008462

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791321.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791321.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791321.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791321.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791321.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40920721`	`TA`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B105,B31,B51,B94
`Chr2:40920726`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B103,B37,B7,C44,C5,C62
`Chr2:40920730`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B103,B37,B7,C44,C5,C62
`Chr2:40920734`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A5,A8,B103,B104,B111,B112,B29,B44,B58,B65,B72,B8,B99,C1,C10,C14,C21,C25,C28,C33,C41,C44,C45,C5,C64,C69,C8,C80,D10,D2
`Chr2:40920747`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A5,A8,B104,B112,B29,B44,B58,B59,B65,B72,B8,B99,C1,C10,C14,C21,C26,C28,C33,C41,C43,C45,C64,C69,C75,C8,C80,D2
`Chr2:40920760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B100,B34,B37,B44,B78,C47,C70,C8
`Chr2:40920762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B36,B51
`Chr2:40920773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C30
`Chr2:40920783`	`GC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C43
`Chr2:40920802`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B122,B133,C8
`Chr2:40920802`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B122,B133,C8
`Chr2:40920808`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B122,B133,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791321.1

264 aa

132

264

RVT_1

PF00078 RVT_1 4-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791321.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	4	125	1.4e-16	61.7	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935338.1
ATGGGATCAATTATATCGAACAACCAAAGCGCTTTTGTCAAAGGTCGCTACATCCTTGATGGGGTGGTAATACTTAACGAATCAATCATGGAGGCGAAGAAAAAGAAAATGGGGAGAACTTTTTTCAAGATTGATTTTGCAAAGGCATACGACTCCGTCGAGTGGGACTTCCTCGATGCATTGCTTGTTAATTTTAGCTTTGATAGCAAGTGGAGAAAGTGGATGAAGGGGTGTTTGTATTCAGCCTCGGCAAGTATACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008462
ATGGGATCAATTATATCGAACAACCAAAGCGCTTTTGTCAAAGGTCGCTACATCCTTGATGGGGTGGTAATACTTAACGAATCAATCATGGAGGCGAAGAAAAAGAAAATGGGGAGAACTTTTTTCAAGATTGATTTTGCAAAGGCATACGACTCCGTCGAGTGGGACTTCCTCGATGCATTGCTTGTTAATTTTAGCTTTGATAGCAAGTGGAGAAAGTGGATGAAGGGGTGTTTGTATTCAGCCTCGGCAAGTATACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791321.1
MGSIISNNQSAFVKGRYILDGVVILNESIMEAKKKKMGRTFFKIDFAKAYDSVEWDFLDALLVNFSFDSKWRKWMKGCLYSASASILVNGSSTKDFKMERGLRQGDPMSPFCFLIIAEGLNALVERAIARELLFMSGLAVNFEKSSIMGVGMAEEKIERWPEMLGCRVGSLPFSYLSLKVGGRANNSVDWIRLEEKVSNKIKGWKKNPTSLAGRITLVKSVLQVIPVYQLSFATISKSVVRNLGSMCGKFLWAGGERGQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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