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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002326`

染色体: Chr02 坐标: 40939951-40942313 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002326`
名称	SmilChr02G002326
描述	30S ribosomal protein S5, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40939951 - 40942313 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013445`
GeneID	`131013445`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013445`
原始查询	`SmilChr02G002326`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein S5, chloroplastic
产物	30S ribosomal protein S5%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G33800` (EMB3113) Ribosomal protein S5 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817947] identity=75.3; qcov=0.875; evalue=1.03e-141; confidence=high
Rice	`Os03g0452300` - identity=66.7; qcov=0.738; evalue=8.97e-104; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0015935 (small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00333 (Ribosomal_S5); PF03719 (Ribosomal_S5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013445

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057797509.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057797509.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797509.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797509.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797509.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40940264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B101,B11,B45,D11
`Chr2:40941794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr2:40941874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B2,C86,D2
`Chr2:40942052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B101,B45
`Chr2:40942082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C41
`Chr2:40942126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C68
`Chr2:40942133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:40942200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr2:40942213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C61
`Chr2:40942214`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C80
`Chr2:40942214`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797509.1

305 aa

152

305

Ribosomal_S5

Ribosomal_S5_C

PF00333 Ribosomal_S5 149-213 aa PF03719 Ribosomal_S5_C 227-296 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797509.1`	Pfam	`PF00333`	Ribosomal_S5	Domain	149	213	6.3e-23	81.3	Ribosomal protein S5, N-terminal domain
`XP_057797509.1`	Pfam	`PF03719`	Ribosomal_S5_C	Domain	227	296	2.2e-25	88.6	Ribosomal protein S5, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941526.1
TTATCTTCCAAATTCCCAAAATTGGAGCTTCTTATCCCCTCTCTGCAATTCCCACTCACAGTGCTCCATCAATTCCAATGGCAGCCGCCTCTCTCTCCGCCACATTCTTCGCCCTCTCCCTCAATCCCCACCACCACAACCACCCTCCCTTCCCCTCCCACCACCTCCCTTTCTCCGCCTCCAAAACCCCTCTCCCCCTCCTCTCCAAACCCCCTCACCTCCTTCCTCCCCCAAAAGCCGCCTCCGCCGACTTCGAGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013445
ATGGCAGCCGCCTCTCTCTCCGCCACATTCTTCGCCCTCTCCCTCAATCCCCACCACCACAACCACCCTCCCTTCCCCTCCCACCACCTCCCTTTCTCCGCCTCCAAAACCCCTCTCCCCCTCCTCTCCAAACCCCCTCACCTCCTTCCTCCCCCAAAAGCCGCCTCCGCCGACTTCGAGATCCCCTTCTTCGAAGGCGAAGACGGCGAGGTGACCGCCGCATTCAGCCCCCCCGAGCGCCCCGAGGGGTACGTCCCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797509.1
MAAASLSATFFALSLNPHHHNHPPFPSHHLPFSASKTPLPLLSKPPHLLPPPKAASADFEIPFFEGEDGEVTAAFSPPERPEGYVPPPSFDDGPPESEEEIARAFEELYGAAYSGESFLGNDVFEMDAKVKKATGFGSKSKKEKVRDGFDERVVQVRRVTKVVKGGKQLHFRAVVVVGDKQGNVGVGVGKAKEVVAAVQKSAVNARRNIVAVPMTKYKTFPHRSEADYGAARVMLRPASPGTGVIAGGAVRIVLELAGVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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