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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002332`

染色体: Chr02 坐标: 41016474-41017455 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002332`
名称	SmilChr02G002332
描述	auxin-repressed 12.5 kDa protein-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41016474 - 41017455 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013450`
GeneID	`131013450`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013450`
原始查询	`SmilChr02G002332`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin-repressed 12.5 kDa protein-like
产物	auxin-repressed 12.5 kDa protein-like
Arabidopsis	`AT1G28330` (DYL1) dormancy-associated protein-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839729] identity=61.6; qcov=1.03; evalue=9.75e-43; confidence=medium
Rice	`Os11g0671000` (ARP1) - identity=59.5; qcov=1.04; evalue=3.86e-34; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05564 (Auxin_repressed)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013450

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797519.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057797519.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057797519.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797519.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41016970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,C84
`Chr2:41017261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,C16,C60,C61
`Chr2:41017278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797519.1

121 aa

121

Auxin_repressed

PF05564 Auxin_repressed 7-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797519.1`	Pfam	`PF05564`	Auxin_repressed	Family	7	118	2.8e-49	167.3	Dormancy/auxin associated protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941536.1
AAGAAGGTGGAAGATAGAAATGGGAAGATATTTTGCCTCGAATCCTTGTATTTATTTATACATGTATACCACCTTTACTAGTCACTCTCTATATATAATCATCTTATAGAAGAAGAAAAAGTAAATCAATGAAAAATGGTGCTCCTCGATCATCTCTGGGATGATGTGGTGGCGGGGCCGCAGCCCGATCAGCGCGGCCTCAAACACCTCAAGAAGCTTTACACGGCCAAGCCCTTGAACATCAAAGATATTGGAGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013450
ATGGTGCTCCTCGATCATCTCTGGGATGATGTGGTGGCGGGGCCGCAGCCCGATCAGCGCGGCCTCAAACACCTCAAGAAGCTTTACACGGCCAAGCCCTTGAACATCAAAGATATTGGAGTGGAGGGAAGCAGCAAGTACCCGAGATCTGTGTCGATGCCGTCGAGTCCGGCAACGCCGGGGACGCCGTCGCCCACCGCCCTGAGGAAGGACAACGTGTGGCGGAGCGTCTTCCACCCCGGCAGCAACCTCGCCACCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797519.1
MVLLDHLWDDVVAGPQPDQRGLKHLKKLYTAKPLNIKDIGVEGSSKYPRSVSMPSSPATPGTPSPTALRKDNVWRSVFHPGSNLATKTIGANYFDRPEPNSPTVYDWLYSGETRSKHHEKV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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