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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002339`

染色体: Chr02 坐标: 41092098-41098019 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002339`
名称	SmilChr02G002339
描述	T-complex protein 1 subunit beta
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41092098 - 41098019 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013455`
GeneID	`131013455`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013455`
原始查询	`SmilChr02G002339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	T-complex protein 1 subunit beta
产物	T-complex protein 1 subunit beta
Arabidopsis	`AT5G20890` (AT5G20890) TCP-1/cpn60 chaperonin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832213] identity=89.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0619400` - identity=88.8; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005829 (cytosol); GO:0005832 (chaperonin-containing T-complex); GO:0006457 (protein folding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	-
Pfam	PF00118 (Cpn60_TCP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013455

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797529.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797529.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057797529.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057797529.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797529.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41093199`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A22,A23,A8,B101,B102,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B128,B129,B133,B134,B140,B20,B4,B52,B61,B68,B7,B70,B76,B87,B95,B98,C12,C13,C20,C27,C28,C29,C32,C33,C35,C42,C53,C58,C63,C75,C77,C82,C85,D2
`Chr2:41093241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:41093270`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	68	A1,A11,A13,A14,A19,A23,A8,B102,B110,B117,B118,B119,B12,B121,B128,B129,B133,B134,B140,B20,B24,B26,B30,B33,B4,B45,B52,B6,B61,B65,B7,B70,B81,B82,B84,B87,B94,B95,B98,C12,C13,C16,C20,C25,C27,C28,C29,C32,C33,C35,C40,C42,C45,C50,C53,C54,C55,C65,C70,C72,C75,C77,C8,C82,C84,C85,D2,D3
`Chr2:41093384`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C16,C55,C65
`Chr2:41093384`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C16,C55,C65
`Chr2:41093393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B109,B66,C85
`Chr2:41094221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:41094320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:41094866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:41095643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B109,B66,B68,C85
`Chr2:41096119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:41097469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797529.1

526 aa

263

526

Cpn60_TCP1

PF00118 Cpn60_TCP1 29-517 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797529.1`	Pfam	`PF00118`	Cpn60_TCP1	Family	29	517	5.2e-157	524.2	TCP-1/cpn60 chaperonin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941546.1
ATTATAAAATACAAAAATAAAATGAAAGAATTCCGAATCTAAGTTCAAACGGGCGCCGCTCTTCTTCACGCTCATTTCTCAGAACCGCCGCGCCAAGCTGCTTCTTCACAGATTTCTCCTCTAAGGCTTCTTCTTCTTCATTACGTGAATCGCATAGGATCCAACATTATTCAGTCTTCAATTCAAATTCTGCTCTCATAATGGTTGATACACTTTTTAAAGATGAAGCTACTGAAGAAAAGGGGGAGCGTGCCAGAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013455
ATGGTTGATACACTTTTTAAAGATGAAGCTACTGAAGAAAAGGGGGAGCGTGCCAGAATGGCCTCCTTCATTGGAGCAATGGCAATTGCTGACTTGGTCAAGACAACCTTGGGACCTAAAGGGATGGATAAAATTTTGCAATCTACGGGTAGAGGACATGGTGTGACTGTTACAAATGATGGAGCAACCATATTGAAGTCACTGCACATTGACAACCCTGCTGCTAAAGTCCTTGTCGACATATCAAAAGTCCAAGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797529.1
MVDTLFKDEATEEKGERARMASFIGAMAIADLVKTTLGPKGMDKILQSTGRGHGVTVTNDGATILKSLHIDNPAAKVLVDISKVQDDEVGDGTTSVVVLAGELLREAEKLVNSKIHPMTIIAGYRMAAECARNALVEKVVDNKLDAEKFEKDLMKIAMTTLSSKILSQDKEHFAKLAVDAVMRLKGSTNLESIQIIKKPGGSLKDSFLDEGFILDKKIGVGQPKRIENAKILVANTAMDTDKVKIYGARVRVDSMAKVAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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