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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002346`

染色体: Chr02 坐标: 41234565-41235414 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002346`
名称	SmilChr02G002346
描述	uncharacterized SmilChr02G002346
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41234565 - 41235414 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008468`
GeneID	`131008468`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008468`
原始查询	`SmilChr02G002346`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0630250; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=24.5; qcov=0.617; evalue=4.77e-07; confidence=weak
Rice	`Os02g0630250` - identity=31.8; qcov=0.489; evalue=4.75e-07; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008468

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791327.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791327.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791327.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057791327.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791327.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41234587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C4,C84
`Chr2:41234614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C40
`Chr2:41234711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B93,C15,C17,C4,C84
`Chr2:41234738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,C35,C64,C66,C81
`Chr2:41234744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B13
`Chr2:41234747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B13
`Chr2:41234776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B68
`Chr2:41234776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:41234828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:41234829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B32,C32,C49,C68,C87
`Chr2:41234834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:41234851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A25,B103,B121,B13,B134,B17,B56,B85,B92,B96,C10,C14,C61,C82,C87,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791327.1

264 aa

132

264

RVT_3

PF13456 RVT_3 144-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791327.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	144	231	1.7e-11	44.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935344.1
ATGGATTTTCTTGGTTGGTTTCATCAGGGTGATTCTGGGCATGCACCGGATATTCATAGCTTCCTGGTTTTGGCTTGGAATGCTAAGTTCAGTTCTCAAGTGAACTCCTTTTGGAAGTTAGGTGTTTTGTCGATTCTTTGGCGTATCTGGGAGGGGAGGAACCGAGCTATTTTCAATGATGAGAGTTTCGATCCAAGGGCTGTGATGAGCTTCGTTAAAGTGGCGTTTAAGGAGCTCGATGCGTCATCGTTTAAAATCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008468
ATGGATTTTCTTGGTTGGTTTCATCAGGGTGATTCTGGGCATGCACCGGATATTCATAGCTTCCTGGTTTTGGCTTGGAATGCTAAGTTCAGTTCTCAAGTGAACTCCTTTTGGAAGTTAGGTGTTTTGTCGATTCTTTGGCGTATCTGGGAGGGGAGGAACCGAGCTATTTTCAATGATGAGAGTTTCGATCCAAGGGCTGTGATGAGCTTCGTTAAAGTGGCGTTTAAGGAGCTCGATGCGTCATCGTTTAAAATCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791327.1
MDFLGWFHQGDSGHAPDIHSFLVLAWNAKFSSQVNSFWKLGVLSILWRIWEGRNRAIFNDESFDPRAVMSFVKVAFKELDASSFKIGSVSNSWRDYLITRSLGVVSRASPPPLMIEVYWWPPVGQWIKVNTDGSAAGSPGAIAAGGRGYAFEAELHAVITAIAIAHARGWMFLWIEADSMYVVNLLSSRARDVPWRFVASWNRTLHLLTDMQIMVSHIYREGNVAADIMANPDRSEGWWPHAIDDVRKAVALDMATHSFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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