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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002358`

染色体: Chr02 坐标: 41365482-41368906 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002358`
名称	SmilChr02G002358
描述	cyanidin 3-O-galactoside 2''-O-xylosyltransferase FGGT1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41365482 - 41368906 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013471`
GeneID	`131013471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013471`
原始查询	`SmilChr02G002358`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyanidin 3-O-galactoside 2''-O-xylosyltransferase FGGT1-like
产物	cyanidin 3-O-galactoside 2''-O-xylosyltransferase FGGT1-like
Arabidopsis	`AT5G54010` (AT5G54010) UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835484] identity=46.7; qcov=1.01; evalue=2.77e-152; confidence=high
Rice	`Os11g0457300` (UGT) - identity=36.9; qcov=1.03; evalue=1.62e-92; confidence=medium
GO	GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity)
KEGG	smil00944 (Flavone and flavonol biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00201 (UDPGT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797546.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797546.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797546.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797546.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797546.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41367323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr2:41367415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr2:41367515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B91,C17
`Chr2:41367525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,C74,C78,C85,C87
`Chr2:41367734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:41367784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:41367799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr2:41367842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:41368122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:41368258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:41368441`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D3
`Chr2:41368441`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797546.1

449 aa

224

449

UDPGT

PF00201 UDPGT 323-409 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797546.1`	Pfam	`PF00201`	UDPGT	Family	323	409	2.9e-12	46.9	UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941563.1
TTCATTCGATGTAATATTTGCCTTTCTCTAGCAATTATTTCATTAGGCGGGCATTTGAAATTGAATTCGAATTTTTTGGTTAGAGGCCCAATTGGGGTATGTGTGTTGGTGTTTATTTGATAATAATACACTTAATTGAAGGCGAAAATCTGGAGAGTCTTGTGTAGGATCGTTACACTGGTCAAGATTCATAAATCGTTATAATTGGTAGTTAGTGTTTTGCATTTTGCATTTTGCATTTTGCATTTGTTTCAAATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013471
ATGGGAAAGAAGATCGCAATGTTCCCATGGTTTGCAATGGGGCATCTGACCACATTTCTTCACATCTCCAACAAACTCGCGCAGAAAGGCCACCGAATCTTCTTCATCCTCCCTCCCAAAACCCAATCCAAACTCAACCAGTTCAATCTCCACCCCGACCTCATCACCTTCATCCCCATCACCCTCCCCCACGTCGACGGCCTCCCTCCTGGGACCGAGACCACCGCCGACGTCATCTTCCCCATGTACTCGCTCCTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797546.1
MGKKIAMFPWFAMGHLTTFLHISNKLAQKGHRIFFILPPKTQSKLNQFNLHPDLITFIPITLPHVDGLPPGTETTADVIFPMYSLLRRAMDLTEPALKALLQDLQPHLVFFDFSHWLPALARSLGIKSLLYCIISPAAVAYLFRDEPAAEDYMRPPPGFPPSSAIRLYANEARTVDAVNNMEEFGTPMKFVQRVIMAAEECDAMGFKSCREMEGPYLDFLEKRFKKPVLLAGPVLPEPPASGLDERWVKWLDQFGPKSVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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