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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002359`

染色体: Chr02 坐标: 41375089-41377936 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002359`
名称	SmilChr02G002359
描述	uncharacterized SmilChr02G002359
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41375089 - 41377936 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013473`
GeneID	`131013473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013473`
原始查询	`SmilChr02G002359`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0752800; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0752800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G46020` (AT5G46020) 28 kDa heat/acid-stable phosphoprotein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834642] identity=68.3; qcov=1.02; evalue=2.15e-51; confidence=high
Rice	`Os01g0752800` - identity=71.1; qcov=1.04; evalue=1.29e-70; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF10252 (PP28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797548.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057797548.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057797548.1`
4	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057797549.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057797548.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41375349`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B112
`Chr2:41375349`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B112
`Chr2:41375353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr2:41376695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr2:41377578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797548.1

188 aa

188

PP28

PF10252 PP28 72-149 aa

XP_057797549.1

160 aa

160

PP28

PF10252 PP28 72-149 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797548.1`	Pfam	`PF10252`	PP28	Domain	72	149	6.6e-28	97.6	Casein kinase substrate phosphoprotein PP28
`XP_057797549.1`	Pfam	`PF10252`	PP28	Domain	72	149	9e-28	97.2	Casein kinase substrate phosphoprotein PP28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941566.1
ACATTGAACACAAAAAGATTTTTTCCAAACGACTCTCCTTTCGGAATTCGGATTTGGGTAACTGATTCAATAAAAAGGCCCTCTTATAAATATACTCGAGTCTAATTTACAAAAAAAAGAAAACGAAAAAAGATATACTCGAATCGCCCATTGTCGCCATTTCTTCGGTAAGCAGAGGAGACTACACTCTGTCAAGCATCAAGTATCATGGGGAGAGGCAAGTTCAAGGGCAAGCCCACCGGCCACCGCCAGTTCTCCAC...

XM_057941565.1
AAAAAGATTTTTTCCAAACGACTCTCCTTTCGGAATTCGGATTTGGGTAACTGATTCAATAAAAAGGCCCTCTTATAAATATACTCGAGTCTAATTTACAAAAAAAAGAAAACGAAAAAAGATATACTCGAATCGCCCATTGTCGCCATTTCTTCGGTAAGCAGAGGAGACTACACTCTGTCAAGCATCAAGTATCATGGGGAGAGGCAAGTTCAAGGGCAAGCCCACCGGCCACCGCCAGTTCTCCACTCCCGAGGAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013473
ATGGGGAGAGGCAAGTTCAAGGGCAAGCCCACCGGCCACCGCCAGTTCTCCACTCCCGAGGAGATGCTGGCTGGTACCTCTTCTCGTCCTCGCACCTTCAAGAAGGAAGTCGCTGAGGACGTAGAAGATGAGATATCTGATGAAGAATCTGAAGAGGAGTCTGAAGATGAATCTGAGAAGGTGAAAGGACCCCAGGGTATCATTCAGACAGAAAATCCCAACTTGTCAAAGCCAAAGAACTTGAAAGCACGGGACCTTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797548.1
MGRGKFKGKPTGHRQFSTPEEMLAGTSSRPRTFKKEVAEDVEDEISDEESEEESEDESEKVKGPQGIIQTENPNLSKPKNLKARDLDLEKTTELSRREREEIEKQRAHERYMRLQEQGKTEQARKDLDRLALIRQERAEAAKKREEEKAGTYLYIQLAAFILQKCRWLILCYSFLLVAKEQKKLEIRK

XP_057797549.1
MGRGKFKGKPTGHRQFSTPEEMLAGTSSRPRTFKKEVAEDVEDEISDEESEEESEDESEKVKGPQGIIQTENPNLSKPKNLKARDLDLEKTTELSRREREEIEKQRAHERYMRLQEQGKTEQARKDLDRLALIRQERAEAAKKREEEKAAKEQKKLEIRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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