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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002379`

染色体: Chr02 坐标: 41698427-41699453 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002379`
名称	SmilChr02G002379
描述	protein DOG1-like 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41698427 - 41699453 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013492`
GeneID	`131013492`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013492`
原始查询	`SmilChr02G002379`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DOG1-like 3
产物	protein DOG1-like 3
Arabidopsis	`AT4G18690` (AT4G18690) delay of germination protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827603] identity=44; qcov=1.01; evalue=8.17e-68; confidence=medium
Rice	`Os05g0560200` (OsDOG1L-3) - identity=34.9; qcov=0.883; evalue=5.78e-26; confidence=low
GO	GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF14144 (DOG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013492

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797582.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057797582.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057797582.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797582.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797582.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41698516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr2:41698828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr2:41698840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:41698864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C43
`Chr2:41698900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:41699017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B81,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797582.1

240 aa

120

240

DOG1

PF14144 DOG1 25-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797582.1`	Pfam	`PF14144`	DOG1	Family	25	97	4.2e-29	101.3	Seed dormancy control

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941599.1
ACAAAAGTACATGATAGTGGGATGGTGTGCTCGTGGATGATCAGAGCAAAATATCCGTCTTTGCAAAAGTAAATTGAATGGAAAGTTTGTCTTGTTGTAGAGTAGCGCCAAATAATATATGAAGAATTAAAGTGAGGAAGAGCATCAACCGCACTGCCTTGCCATTCACATATAAATATTTAGTCCAACTCCACCAACACACTTAATTTCCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGGCAGCAAGCGACCAAAGCAAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013492
ATGGCAGCAAGCGACCAAAGCAAAGAAGCCTGCCACTACCAAGAGTGGATGAACCTCCAAGAGGAGGAGCTCTCGGAGCTGAACGAGGCGGCGTGCAGCAACGACGCCGAGCTGAGCCGACTGGTGGAGAAAATCATGAACCACTTCGAAGAGTACATGCGGCAGCGCCAGCTGATGGCCCGCGCCGACGTGTCTCCCTACTTCGCCCCCACGTGGTGCTCCTCCCTCGAGCGCTCCGTGCTCTGGATCGGCGGCTGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797582.1
MAASDQSKEACHYQEWMNLQEEELSELNEAACSNDAELSRLVEKIMNHFEEYMRQRQLMARADVSPYFAPTWCSSLERSVLWIGGCRPSSYIRLIYALCGLEIESQLTDFLHGVHLGSLAHLSACQLAAVDDLHRKTIRDERSLSTRQASLQEDLLDTPIASIAVAPHAAGGNVEAALDKHARAMAEVLEEADRLRLATVREIVRILTPRQAVDFLAAGKKLRLCMQEWGKKRDLDHGRN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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