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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002389`

染色体: Chr02 坐标: 41817003-41819100 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002389`
名称	SmilChr02G002389
描述	probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41817003 - 41819100 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008481`
GeneID	`131008481`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008481`
原始查询	`SmilChr02G002389`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710
产物	probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710
Arabidopsis	`AT1G35710` (AT1G35710) kinase family with leucine-rich repeat domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840475] identity=32.4; qcov=1.18; evalue=4.44e-35; confidence=low
Rice	`Os02g0216000` (B1307A11.13) - identity=31.1; qcov=1.15; evalue=2.53e-31; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008481

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057791338.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057791338.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057791338.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057791338.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791338.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41817026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C53
`Chr2:41817458`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B31,B50,C18,C86
`Chr2:41817458`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B31,B50,C18,C86
`Chr2:41817498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C20,C43
`Chr2:41817757`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A23,C19,C20,C32,C43,C68
`Chr2:41818117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B24,C10,C85,D10
`Chr2:41818256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:41818298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B24,C10,D10
`Chr2:41818335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B41
`Chr2:41818335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791338.1

280 aa

140

280

LRR_1

PF00560 LRR_1 17-32 aa PF00560 LRR_1 103-122 aa PF00560 LRR_1 195-217 aa PF00560 LRR_1 262-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791338.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	17	32	9.8e-15	52.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057791338.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	103	122	9.8e-15	52.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057791338.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	195	217	9.8e-15	52.2	Leucine Rich Repeat
`XP_057791338.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	262	280	9.8e-15	52.2	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935355.1
ATGGGGCTTGCCAGCAGCATTCCACCACAACTAGGAGACCTCTCCTTCCTTGTCTCACTCGACCTCAGACGCAACAATTTCAGCGGCACTTTGCCTATTGCGTCGCCTGAAATTTATTTCTGCGAGAGTGTTCTACCACAGGAACTTGGCAAACTTCAAAACCTGGTTGAGATCAATGTTGGATGGAATGAGATTACGGGGGAATTGCCCCTCAATATCTTCAATATCTCTTCTTCGCTAGTTCTAGACCTCTGGAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008481
ATGGGGCTTGCCAGCAGCATTCCACCACAACTAGGAGACCTCTCCTTCCTTGTCTCACTCGACCTCAGACGCAACAATTTCAGCGGCACTTTGCCTATTGCGTCGCCTGAAATTTATTTCTGCGAGAGTGTTCTACCACAGGAACTTGGCAAACTTCAAAACCTGGTTGAGATCAATGTTGGATGGAATGAGATTACGGGGGAATTGCCCCTCAATATCTTCAATATCTCTTCTTCGCTAGTTCTAGACCTCTGGAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791338.1
MGLASSIPPQLGDLSFLVSLDLRRNNFSGTLPIASPEIYFCESVLPQELGKLQNLVEINVGWNEITGELPLNIFNISSSLVLDLWRNELHGNLSGDVGNLTMLTDLVLSENSFTGVIPREIGQRLYPLELVILGPNMFTGSILPEVFNISTLILLSFSVNGLSGNNLTIESSSELNHHLQKIKGRISVETGNLTNLITLSLDNNDLTGNIPLTLKHLFKLQGLYLGNSYIKGSIPHGLCDLHSLSELLEGPIPVSIGSMI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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