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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002399`

染色体: Chr02 坐标: 41879172-41880548 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002399`
名称	SmilChr02G002399
描述	senescence-specific cysteine protease SAG39-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41879172 - 41880548 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013508`
GeneID	`131013508`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013508`
原始查询	`SmilChr02G002399`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	senescence-specific cysteine protease SAG39-like
产物	senescence-specific cysteine protease SAG39-like
Arabidopsis	`AT5G45890` (SAG12) senescence-associated 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834629] identity=57.5; qcov=1.02; evalue=5.7e-142; confidence=high
Rice	`Os04g0206300` (SAG39) - identity=61; qcov=1.02; evalue=4.68e-147; confidence=high
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0005615 (GO:0005615); GO:0005764 (lysosome); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	-
Pfam	PF00112 (Peptidase_C1); PF08246 (Inhibitor_I29)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013508

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057797600.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057797600.1`
3	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057797600.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797600.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797600.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41879547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B7,C37,C4
`Chr2:41879570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:41879622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,C84
`Chr2:41879792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,C84
`Chr2:41879822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr2:41879858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,A6,B35,C43,D3
`Chr2:41879864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,A6,B35,C43
`Chr2:41880020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B65,C8
`Chr2:41880032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B65,C8
`Chr2:41880149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B78,C50,C55
`Chr2:41880234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797600.1

338 aa

169

338

Inhibitor_I29

Peptidase_C1

PF08246 Inhibitor_I29 35-92 aa PF00112 Peptidase_C1 122-337 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797600.1`	Pfam	`PF08246`	Inhibitor_I29	Domain	35	92	1.6e-18	67.5	Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)
`XP_057797600.1`	Pfam	`PF00112`	Peptidase_C1	Domain	122	337	4e-85	286.1	Papain family cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941617.1
GCTCTCCTCCTTCAATACTATTAATACATTATCCTCTTCAAACATGGCACTCACACTCAAATGGAGGCTTGTTTTAGCTGCATTATTGATGTGGGCTTCTCTCGCCGCAGCTCGAACTGCACCCGATGCATCAATGGCGGAGATGCATGAGAAATGGATGGTGGAGCACAGCCGTGTCTACAAAGATGATGCCGACAAGGCCTACAGATTCAGTATATTCAAGGACAACGTCAACTATATCGACTCGTTTAATGAAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013508
ATGGCACTCACACTCAAATGGAGGCTTGTTTTAGCTGCATTATTGATGTGGGCTTCTCTCGCCGCAGCTCGAACTGCACCCGATGCATCAATGGCGGAGATGCATGAGAAATGGATGGTGGAGCACAGCCGTGTCTACAAAGATGATGCCGACAAGGCCTACAGATTCAGTATATTCAAGGACAACGTCAACTATATCGACTCGTTTAATGAAGCAGCTGCAAAGCCTTACAAGCTTGCTGTCAACAAATTTGCTGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797600.1
MALTLKWRLVLAALLMWASLAAARTAPDASMAEMHEKWMVEHSRVYKDDADKAYRFSIFKDNVNYIDSFNEAAAKPYKLAVNKFADLTNEEFRASRNGYKMASFPKSSKVLSFRYANVSAAPASMDWRKKGAVTAVKDQGQCGCCWAFSAVAATEGINQLKTGKLISLSEQELVDCDTSEDQGCNGGLMDYAFEFIIGNKGLTTESNYPYQGVDGTCNSKKESSDAAKITGYEDVPANSESALLKAVVNQPVSVAIDAGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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