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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002415`

染色体: Chr02 坐标: 42118035-42119177 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002415`
名称	SmilChr02G002415
描述	uncharacterized SmilChr02G002415
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42118035 - 42119177 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008489`
GeneID	`131008489`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008489`
原始查询	`SmilChr02G002415`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G41590` (AT2G41590) Ta11-like non-LTR retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818757] identity=26.9; qcov=0.558; evalue=1.45e-18; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=32.2; qcov=0.539; evalue=8.74e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008489

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791346.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057791346.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791346.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791346.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791346.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42118044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr2:42118047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,A22,B137,B18
`Chr2:42118050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:42118054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr2:42118063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C13
`Chr2:42118068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,D11
`Chr2:42118092`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C29
`Chr2:42118092`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C29
`Chr2:42118103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,C72,C78,C79,C87
`Chr2:42118105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr2:42118108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr2:42118115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,C26,C45,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791346.1

380 aa

190

380

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 29-101 aa PF14392 zf-CCHC_4 168-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791346.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	29	101	1.2e-17	64.0	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057791346.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	168	213	6.2e-18	64.9	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935363.1
ATGGCAGGACTACATCTTGAGGGGGAGGACGATGAACTTCTCCTGGAAGATGAGATTACGGGAGACTCATCGGTCTCAGCGGATCTCTGCCTTGTTGGACGTTTCATCACAGATCAACCAGTGAATTTCAACTTGATGCGAAGCCGTCTTGCCAGCATCTGGCGTCCGGGGAAAGGGGTCTTCATGAAAGATATTGGGGAGGGCCGTTTTATTTTCCAATTCTTCCACGAAGTAGATCTCAAACGTGTCTTTGAAGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008489
ATGGCAGGACTACATCTTGAGGGGGAGGACGATGAACTTCTCCTGGAAGATGAGATTACGGGAGACTCATCGGTCTCAGCGGATCTCTGCCTTGTTGGACGTTTCATCACAGATCAACCAGTGAATTTCAACTTGATGCGAAGCCGTCTTGCCAGCATCTGGCGTCCGGGGAAAGGGGTCTTCATGAAAGATATTGGGGAGGGCCGTTTTATTTTCCAATTCTTCCACGAAGTAGATCTCAAACGTGTCTTTGAAGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791346.1
MAGLHLEGEDDELLLEDEITGDSSVSADLCLVGRFITDQPVNFNLMRSRLASIWRPGKGVFMKDIGEGRFIFQFFHEVDLKRVFEGGPWSFGNLPLILHHLRRGEFPLKVPLDTLPFWVQIHDLPAGYLTEGIGKLLGKFIGTFLEYDSTNSTGVWRQYMRVRVGVRVDEPLKRFKKIKNKDGSSFTVNFRYERLHIFCFLCGRLGHSENFCELMFNAEAKNSERQWGAWLKAADRRSQTLAGDKWIRTDGGEGNPSGVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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