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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002430`

染色体: Chr02 坐标: 42315145-42315468 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002430`
名称	SmilChr02G002430
描述	uncharacterized SmilChr02G002430
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42315145 - 42315468 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008493`
GeneID	`131008493`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008493`
原始查询	`SmilChr02G002430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=63.9; qcov=0.57; evalue=1.5e-19; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=43; qcov=1; evalue=1.1e-21; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008493

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791350.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057791350.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791350.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791350.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791350.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42315162`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	B123,B132,B16,B17,B36,B51,B90,B92,C12,C56,C81,D6
`Chr2:42315175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	50	A10,A16,A23,A5,B1,B100,B101,B109,B113,B117,B118,B122,B129,B130,B132,B139,B140,B31,B32,B35,B42,B43,B59,B6,B64,B69,B72,B8,B84,B91,B95,C14,C15,C17,C23,C29,C33,C36,C41,C48,C59,C6,C63,C7,C71,C77,C82,C83,D4,D9
`Chr2:42315220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,C27,C44,C73
`Chr2:42315234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A14,C43
`Chr2:42315234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C43
`Chr2:42315266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B138,B25,B44
`Chr2:42315273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:42315282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C27
`Chr2:42315285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A5,B98,C27
`Chr2:42315301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr2:42315323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B48,C20
`Chr2:42315323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791350.1

107 aa

107

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 2-56 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791350.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	2	56	3.8e-22	79.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935367.1
ATGCAGGAAGCGGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCCTTCAGCGTCCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCGTCAAAGGCCCATCGTGTCTTTGGAGCAAGGAGGAGATGGGCGACATCATGTTCACGTGCATCATTTTGCACAACATGATTATCGAAGACGAAGGCGAGCACGCAACACAGTGGGAAGAAGACGCCGACGAAGCTTCGAGTAGCGCCGCATCTCAACCTCGTGCCGGTGCTCCGCCGGATTTTCGTGCATTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008493
ATGCAGGAAGCGGCTCGCAAGGATATTGAACGAGCCTTCAGCGTCCTTCAAGCTCGTTGGGCAATCGTCAAAGGCCCATCGTGTCTTTGGAGCAAGGAGGAGATGGGCGACATCATGTTCACGTGCATCATTTTGCACAACATGATTATCGAAGACGAAGGCGAGCACGCAACACAGTGGGAAGAAGACGCCGACGAAGCTTCGAGTAGCGCCGCATCTCAACCTCGTGCCGGTGCTCCGCCGGATTTTCGTGCATTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791350.1
MQEAARKDIERAFSVLQARWAIVKGPSCLWSKEEMGDIMFTCIILHNMIIEDEGEHATQWEEDADEASSSAASQPRAGAPPDFRAFVARQASMRDAEMHARLTLDLK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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