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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002437`

染色体: Chr02 坐标: 42527911-42530700 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002437`
名称	SmilChr02G002437
描述	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42527911 - 42530700 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013534`
GeneID	`131013534`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013534`
原始查询	`SmilChr02G002437`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1-like
产物	protein GRAVITROPIC IN THE LIGHT 1-like
Arabidopsis	`AT1G29300` (UNE1) intracellular protein transporter, putative (DUF641) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839804] identity=45.2; qcov=1.04; evalue=2.83e-127; confidence=high
Rice	`Os01g0203800` - identity=40.5; qcov=0.882; evalue=1.62e-80; confidence=medium
GO	GO:0009639 (response to red or far red light); GO:0009959 (negative gravitropism)
KEGG	-
Pfam	PF04859 (DUF641); PF24994 (GIL1_IRKI_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013534

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797632.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057797632.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057797632.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797632.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797632.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42529112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B70,C57,C58
`Chr2:42529209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,C27,C44
`Chr2:42529220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:42529365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:42529637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,C27,C44
`Chr2:42529688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:42529700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B67,C1,C44,C55,D3
`Chr2:42530108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B6,B68,C3,C67
`Chr2:42530394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797632.1

442 aa

221

442

DUF641

GIL1_IRKI_C

PF04859 DUF641 62-185 aa PF24994 GIL1_IRKI_C 385-436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797632.1`	Pfam	`PF04859`	DUF641	Family	62	185	1.2e-42	146.0	Plant protein of unknown function (DUF641)
`XP_057797632.1`	Pfam	`PF24994`	GIL1_IRKI_C	Domain	385	436	1.7e-17	63.9	GIL1/IRKI C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941649.1
ATGCTCAAATTCATAATTTTTCGTATATCATCTGCGCGCATGCAAATTGCTCTCTTTATTTAAATTAACTCCTTTTCCATTTCTTCTTCCTTTCTAAATCTTCATATCTCCACATTCAAAACAGTCAAACAATTTCACCTGCTTTTCAAATCTGTTCCTTTGTTTCACACTCAAACATCATTCAAAAAATTCAAATTCCAGTTTCATCAGTCTCCATGCTCTGATCAAGAAAAGCTCCCTTTTGTTTTATATATAGATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013534
ATGGATTCAATCCCAACTCCAAGAAGAAGCAAATTCGCAAAAACATTTTCAAAAATAACGAACCTCAAAAAATCCACAAAGAATCGCTCGAATTCCGGATTTTGCATCCCGATCACGGCGGAAAAGCTGCGATGCTGCGAGTCGAAGCTGTTCGATGAAGAAGCCATGGCGGAGCTGCGAGACAGAGCCGCCATGGAAGCTTTCGTGGCGAAGCTCTTCGCGGCGGTTTCCTCCGTGAAGGCAGCCTACGCCGCGCAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797632.1
MDSIPTPRRSKFAKTFSKITNLKKSTKNRSNSGFCIPITAEKLRCCESKLFDEEAMAELRDRAAMEAFVAKLFAAVSSVKAAYAAQQMAQLPYDDAAVQSADQAVVDELRAVSELKRRFLKNQIDSSPPHVVVMLAEIQEQQSLMKTYEITMRKMQREIDHKSSQISSLREKLKEINRSNRVMEKTMNATGNFSVLETVSFHNLSVNDFVVVLNYALKSVRHFVKQMIRDMESANWDIDAAVNAILGGVKFSKRDHRGFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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