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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002439`

染色体: Chr02 坐标: 42596515-42599981 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002439`
名称	SmilChr02G002439
描述	uncharacterized SmilChr02G002439
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42596515 - 42599981 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013536`
GeneID	`131013536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013536`
原始查询	`SmilChr02G002439`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ubiquitin domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841776]; symbol=AT1G53400; hit=AT1G53400; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ubiquitin domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841776]; symbol=AT1G53400; hit=AT1G53400; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G53400` (AT1G53400) Ubiquitin domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841776] identity=87.4; qcov=0.896; evalue=2.76e-60; confidence=high
Rice	`Os09g0345000` - identity=80; qcov=0.943; evalue=9.23e-58; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16455 (UBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797634.1`
2	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797636.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797635.1`
4	Ruffle	Ruffle	0.60000	`XP_057797636.1`
5	Focal adhesion	Focal adhesion	0.20000	`XP_057797636.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42596888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B5,B71,C62,C78
`Chr2:42596889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B5,B71,C62,C78
`Chr2:42598603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B31,C14,C29,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797634.1

126 aa

126

UBD

PF16455 UBD 13-93 aa

XP_057797635.1

120 aa

120

UBD

PF16455 UBD 7-87 aa

XP_057797636.1

112 aa

112

UBD

PF16455 UBD 13-110 aa

XP_057797637.1

106 aa

106

UBD

PF16455 UBD 7-104 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797634.1`	Pfam	`PF16455`	UBD	Domain	13	93	1.9e-28	99.4	Ubiquitin-binding domain
`XP_057797635.1`	Pfam	`PF16455`	UBD	Domain	7	87	1.6e-28	99.6	Ubiquitin-binding domain
`XP_057797636.1`	Pfam	`PF16455`	UBD	Domain	13	110	2e-38	131.4	Ubiquitin-binding domain
`XP_057797637.1`	Pfam	`PF16455`	UBD	Domain	7	104	1.6e-38	131.7	Ubiquitin-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941653.1
GAACATATTTATTTATTTCGTAACCTTATCCTTTTATGGGAAGATGTAATTTTTTGCCGTTTTTTGAAACTATTATCATTTTCACTTTCACCCCCAAAAATCAGTGAAATATTTTCAATCAGGCCATTTACCAGAAACTTTTACAGAGATCGTTGAAAAATAATGGACTCCCATCGTCTCCTCACAAATACTTACATAATTCACTCTCAGTTGCATCTCACAGAGAGAGAGGGGAATCATTTTCGCTCTCTCTACGTATT...

XM_057941651.1
AGATCGTTGAAAAATAATGGACTCCCATCGTCTCCTCACAAATACTTACATAATTCACTCTCAGTTGCATCTCACAGAGAGAGAGGGGAATCATTTTCGCTCTCTCTACGTATTAGCATTAGGAAATTTTCGTTATTGAATTCAGGCACCTGAAACATTTGAGCGGAGAGGAGATCGCCGATTGCGTGTGATTGCACGCAATGGGTTGCGCTGGATCGCGGGAGAAAGGGAGTGAGTCTAAAAAGATTCGAAAACCCAAA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131013536
ATGGGTTGCGCTGGATCGCGGGAGAAAGGGAGTGAGTCTAAAAAGATTCGAAAACCCAAAGCCTGGAAGCATTCAGAGCCAATAACAAGAGCACAACTGACGCAGATGCGTGAGGAGTTCTGGGACACTGCTCCACACTATGGTGGTCGTAAAGAAATTTGGGATGCACTCCGAGCAGCAGCGGAAGCCGATTCCACCCTTGCACAAGCAATCGTGGACAGCGCAGGTGTCATTGTTCAGAACCCCGACTTAACAATCTG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057797634.1
MGCAGSREKGSESKKIRKPKAWKHSEPITRAQLTQMREEFWDTAPHYGGRKEIWDALRAAAEADSTLAQAIVDSAGVIVQNPDLTICYDERGLLLIWSSNKSDLVKSEVMILMLLQVPSMSCPSMF

XP_057797635.1
MVIWTESKKIRKPKAWKHSEPITRAQLTQMREEFWDTAPHYGGRKEIWDALRAAAEADSTLAQAIVDSAGVIVQNPDLTICYDERGLLLIWSSNKSDLVKSEVMILMLLQVPSMSCPSMF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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