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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002458`

染色体: Chr02 坐标: 42869922-42871322 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002458`
名称	SmilChr02G002458
描述	uncharacterized SmilChr02G002458
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42869922 - 42871322 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008499`
GeneID	`131008499`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008499`
原始查询	`SmilChr02G002458`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=ATMG01250; species=arabidopsis; confidence=low
产物	hit=ATMG01250; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG01250` - identity=31.9; qcov=0.588; evalue=4.43e-07; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=31.4; qcov=0.756; evalue=6.2e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008499

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057791355.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057791355.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791355.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791355.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791355.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42869925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B51
`Chr2:42870982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B51
`Chr2:42871033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,C27,C44,C85
`Chr2:42871127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	140	A1,A11,A14,A18,A19,A2,A21,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A9,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B120,B122,B123,B124,B126,B128,B13,B130,B133,B134,B137,B138,B139,B140,B22,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B32,B34,B36,B38,B39,B4,B40,B44,B45,B47,B50,B51,B54,B55,B57,B59,B62,B64,B66,B69,B7,B70,B71,B72,B75,B76,B77,B83,B85,B87,B89,B9,B93,B94,B95,B97,B99,C10,C11,C13,C14,C16,C17,C18,C2,C21,C25,C28,C3,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C41,C45,C46,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C60,C61,C62,C63,C67,C69,C72,C73,C76,C78,C79,C80,C81,C83,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D5,D9
`Chr2:42871136`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A11,A19,A24,B101,B105,B13,B137,B139,B29,B4,B45,B47,B50,B54,B66,B69,B72,B76,B9,B93,B95,B97,C14,C18,C2,C31,C45,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C86,D1,D11
`Chr2:42871230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:42871236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A9,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791355.1

160 aa

160

RVT_1

PF00078 RVT_1 5-106 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791355.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	5	106	2.9e-07	31.3	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935372.1
ATGTCTAATCTTGTTAATGGTAGTCGTTTAGGTGAGTCCCCCTTCCAAAGAGGTAACAGACAGGGTGGCCCTTTATCTCCTTTCCTCTTTCTCATTGATTTTCAAGGGTTTAATTGTCTTATGAATAAGGCGATCTCTCTTAATCTCTTCGAGAGAGTCGCCATTGGACATGACAAAGTGCTGGTTAACCATTTGCAATTTGCAGATGACACAGTGATAATTAGCGAAGCCTCAATTACTAATGTTATGCTAATCAAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008499
ATGTCTAATCTTGTTAATGGTAGTCGTTTAGGTGAGTCCCCCTTCCAAAGAGGTAACAGACAGGGTGGCCCTTTATCTCCTTTCCTCTTTCTCATTGATTTTCAAGGGTTTAATTGTCTTATGAATAAGGCGATCTCTCTTAATCTCTTCGAGAGAGTCGCCATTGGACATGACAAAGTGCTGGTTAACCATTTGCAATTTGCAGATGACACAGTGATAATTAGCGAAGCCTCAATTACTAATGTTATGCTAATCAAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791355.1
MSNLVNGSRLGESPFQRGNRQGGPLSPFLFLIDFQGFNCLMNKAISLNLFERVAIGHDKVLVNHLQFADDTVIISEASITNVMLIKGILRLFEISYSLRVNFSKSYIHGNIGNPKLAGLAEIIGCKIGSYYNKNADRNRLKTVNITEIVDVHLIDYLFCA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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