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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002462`

染色体: Chr02 坐标: 42947520-42950647 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002462`
名称	SmilChr02G002462
描述	eukaryotic translation initiation factor 4E-2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42947520 - 42950647 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013559`
GeneID	`131013559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013559`
原始查询	`SmilChr02G002462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 4E-2-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 4E-2-like
Arabidopsis	`AT4G18040` (EIF4E) eukaryotic translation initiation factor 4E [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827529] identity=75.3; qcov=0.754; evalue=9.72e-107; confidence=high
Rice	`Os01g0970400` (p26) - identity=72.5; qcov=0.864; evalue=6.28e-111; confidence=high
GO	GO:0000340 (RNA 7-methylguanosine cap binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006413 (translational initiation); GO:0016281 (eukaryotic translation initiation factor 4F complex)
KEGG	-
Pfam	PF01652 (IF4E)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797666.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797666.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057797666.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797666.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797666.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42948292`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C70
`Chr2:42948292`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C70
`Chr2:42950335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:42950378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B6,B68,C67
`Chr2:42950516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B51
`Chr2:42950553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797666.1

236 aa

118

236

IF4E

PF01652 IF4E 62-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797666.1`	Pfam	`PF01652`	IF4E	Domain	62	231	1.6e-62	210.9	Eukaryotic initiation factor 4E

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941683.1
ATATATAAACAGTAAATAACAGTAACCAAAAACAAAATTACGAAAATGATTGAAGAAAATGCAAAATCAGCAACTGCCGCCATGAACGAGGGATCAGAGAGAAACAGCTCCTCATCGATGAAGAAGACCAGCGTCGACGAAGACGAATCAGGGGGGAAGGAGGCGGAGATCGTCGCCGGCGATTCCGACGGCGCGTTGGCGCCGCCGAAAGCGCAGCCGACGCGGCATCCGCTGGAGAATTCGTGGACGTTCTGGTTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013559
ATGATTGAAGAAAATGCAAAATCAGCAACTGCCGCCATGAACGAGGGATCAGAGAGAAACAGCTCCTCATCGATGAAGAAGACCAGCGTCGACGAAGACGAATCAGGGGGGAAGGAGGCGGAGATCGTCGCCGGCGATTCCGACGGCGCGTTGGCGCCGCCGAAAGCGCAGCCGACGCGGCATCCGCTGGAGAATTCGTGGACGTTCTGGTTCGATAATCCCTCCGCCAAATCGAGACAAGCTGCGTGGGGAAGCTCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797666.1
MIEENAKSATAAMNEGSERNSSSSMKKTSVDEDESGGKEAEIVAGDSDGALAPPKAQPTRHPLENSWTFWFDNPSAKSRQAAWGSSIRPVYTFSSVEDFWRVYNNIHHPSKLAVGADFHCFKEKIEPKWEDPICANGGKWTVSFSRGKSDTCWLYTLLALIGEQFDYGDEICGAVVNVRARQEKIALWTKNAANEAAQLSIGRQWKEFLDYNDQIGFIFHADAKRLDRGAKNRYTV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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