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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002482`

染色体: Chr02 坐标: 43211530-43214311 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002482`
名称	SmilChr02G002482
描述	uncharacterized SmilChr02G002482
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	43211530 - 43214311 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013577`
GeneID	`131013577`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013577`
原始查询	`SmilChr02G002482`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsPDCD5; symbol=OsPDCD5; hit=Os05g0547850; species=rice; confidence=high
产物	OsPDCD5; symbol=OsPDCD5; hit=Os05g0547850; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G29850` (AT1G29850) double-stranded DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839863] identity=74.4; qcov=1.02; evalue=1.34e-61; confidence=high
Rice	`Os05g0547850` (OsPDCD5) - identity=80.3; qcov=1; evalue=5.17e-66; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF01984 (dsDNA_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013577

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797684.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797684.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057797686.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797684.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797684.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:43212983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:43213699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797684.1

129 aa

129

dsDNA_bind

PF01984 dsDNA_bind 9-118 aa

XP_057797685.1

129 aa

129

dsDNA_bind

PF01984 dsDNA_bind 9-118 aa

XP_057797686.1

127 aa

127

dsDNA_bind

PF01984 dsDNA_bind 9-120 aa

XP_057797687.1

127 aa

127

dsDNA_bind

PF01984 dsDNA_bind 9-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797684.1`	Pfam	`PF01984`	dsDNA_bind	Family	9	118	4.7e-31	107.9	Double-stranded DNA-binding domain
`XP_057797685.1`	Pfam	`PF01984`	dsDNA_bind	Family	9	118	4.7e-31	107.9	Double-stranded DNA-binding domain
`XP_057797686.1`	Pfam	`PF01984`	dsDNA_bind	Family	9	120	1.9e-31	109.2	Double-stranded DNA-binding domain
`XP_057797687.1`	Pfam	`PF01984`	dsDNA_bind	Family	9	120	1.9e-31	109.2	Double-stranded DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941701.1
ATTCTCAAAAACAAAAAGTGGAGTGAAAATGAAATAAAGATAAACCCGACCCGACAGCGTAATTCGGACGCAATTGTGGGCCCCTTCCGGCCGCCAGAACAAATGCTCAATTTTCTTTTCTCATTTATTTGAAATATTTTTTCAGCGTTCACTCATTCACTGAATTCAAACTCGTGGAAAAGAAATGGCCGACCCGGAATTGGAAGCCATCAGGCAAAGGAGAATGCAGGAGCTAATGGCTCAACGTGGCGCAGGTAGTC...

XM_057941703.1
AAAGATAAACCCGACCCGACAGCGTAATTCGGACGCAATTGTGGGCCCCTTCCGGCCGCCAGAACAAATGCTCAATTTTCTTTTCTCATTTATTTGAAATATTTTTTCAGCGTTCACTCATTCACTGAATTCAAACTCGTGGAAAAGAAATGGCCGACCCGGAATTGGAAGCCATCAGGCAAAGGAGAATGCAGGAGCTAATGGCTCAACGTGGCGCAGGTAGTCATCAAGGTCCTGAGCAGCAGAAAGCGCAGGAAGAA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131013577
ATGGCCGACCCGGAATTGGAAGCCATCAGGCAAAGGAGAATGCAGGAGCTAATGGCTCAACGTGGCGCAGGTAGTCATCAAGGTCCTGAGCAGCAGAAAGCGCAGGAAGAAGCTAAAAGCGAGGCGGAGGAACAAAGACAACTGATGCTGACACGGATTTTGACATCAGAAGCACGGGCAAGACTTGCTCGAATTGCTCTGGTAAAACCCGAGAAGGCCAGGGGAGTTGAGGATGTCATACTGAGAGCTGCCCAAACGGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057797684.1
MADPELEAIRQRRMQELMAQRGAGSHQGPEQQKAQEEAKSEAEEQRQLMLTRILTSEARARLARIALVKPEKARGVEDVILRAAQTGQIVEKVSEERLISLLEQINTQTSKETKVTVSSSGVEFARTSS

XP_057797685.1
MADPELEAIRQRRMQELMAQRGAGSHQGPEQQKAQEEAKSEAEEQRQLMLTRILTSEARARLARIALVKPEKARGVEDVILRAAQTGQIVEKVSEERLISLLEQINTQTSKETKVTVSSSGVEFARTSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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