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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002483`

染色体: Chr02 坐标: 43216843-43218769 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002483`
名称	SmilChr02G002483
描述	two-pore potassium channel 3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	43216843 - 43218769 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013578`
GeneID	`131013578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013578`
原始查询	`SmilChr02G002483`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-pore potassium channel 3-like
产物	two-pore potassium channel 3-like
Arabidopsis	`AT4G18160` (KCO6) Ca2+ activated outward rectifying K+ channel 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827541] identity=59.9; qcov=1.03; evalue=9.92e-166; confidence=high
Rice	`Os09g0299400` (TPKC) - identity=62.2; qcov=0.775; evalue=3.92e-138; confidence=high
GO	GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0022841 (potassium ion leak channel activity); GO:0030322 (stabilization of membrane potential); GO:0071805 (potassium ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00520 (Ion_trans); PF07885 (Ion_trans_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057797688.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057797688.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057797688.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797688.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:43217341`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A13,B117,B123,B133,B18,B31,B35,B59,B85,B88,C67,C69,C76,C84
`Chr2:43217345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr2:43217422`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B22
`Chr2:43217422`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B22
`Chr2:43217431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr2:43217435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr2:43217479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A19,B9,C26,C46,C79
`Chr2:43217479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B9,C26,C46,C79
`Chr2:43217530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B18,B54,C67
`Chr2:43217607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B43,B70,C57,C58
`Chr2:43217717`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C26,C43
`Chr2:43217717`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C26,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797688.1

423 aa

212

423

Ion_trans

Ion_trans_2

PF00520 Ion_trans 142-222 aa PF07885 Ion_trans_2 143-222 aa PF07885 Ion_trans_2 268-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797688.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	142	222	1.7e-07	31.4	Ion transport protein
`XP_057797688.1`	Pfam	`PF07885`	Ion_trans_2	Family	143	222	1.4e-28	99.3	Ion channel
`XP_057797688.1`	Pfam	`PF07885`	Ion_trans_2	Family	268	336	1.4e-28	99.3	Ion channel

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941705.1
TCTAATTGAGCCCATTAATTCTTATTTTATAATTATATATGCCTGCATACAAATTCTATAATGGTTTGAATACTTGCATAATGGGTGACGTTGACTCAGCCTAAAATGGCGCCGAAACAACGCCACGTTCCCTATACGCCACCATTTTTCACCAACACCAAGACTCCATTTTTACTTTGACCCCACAAATTTCAATATAAAAAATCAAAATTTTAAAACCTGCAAATATATTCCCTATTCATGCAATGCCAAGTGCTACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013578
ATGGAGAAAGAGCCACTCCTCCCTTACAGCAGCCCCAGAAGGCCGCCCTTTCTCCACTGTCTACCCGAAGACGATGAAATTACCATCCCACCCTCCCCCCTCACCCCTTCATCCAGAGAACTCAAAGACCGCCTGATTTTCGGCCCCCCCACATCTCCATCTTCATCCACCGCCCCAGATTTTCTTGAAGCTCTAGCCCTAACCCTCAATTCCCCCAAGCCCACATCACAAACCAACGAGGGTTTCGATTTTCATCCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797688.1
MEKEPLLPYSSPRRPPFLHCLPEDDEITIPPSPLTPSSRELKDRLIFGPPTSPSSSTAPDFLEALALTLNSPKPTSQTNEGFDFHPQKSNLDQESQHSLPASKNLHRSKTAPAMANINEIQDFSEAEPPQFGKQSVVRQGVVLLIMYLSLGVVIYSLSRDDFKGSETHPVVDALYFCIVTMCTIGYGDITPNSLATKLFSIMFVLVGFGFIDILLTGMVSYMLDLQENYLLRSIKGRWGGDGRSYIVDVKKGRMRIRMKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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