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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002512`

染色体: Chr02 坐标: 43572007-43573956 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002512`
名称	SmilChr02G002512
描述	cytochrome b561 domain-containing protein At4g18260-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	43572007 - 43573956 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013602`
GeneID	`131013602`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013602`
原始查询	`SmilChr02G002512`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b561 domain-containing protein At4g18260-like
产物	cytochrome b561 domain-containing protein At4g18260-like
Arabidopsis	`AT4G18260` (AT4G18260) Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827552] identity=39.8; qcov=0.985; evalue=2.86e-65; confidence=medium
Rice	`Os05g0565100` - identity=44.3; qcov=0.769; evalue=7.45e-62; confidence=medium
GO	GO:0140575 (transmembrane monodehydroascorbate reductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03188 (Cytochrom_B561)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013602

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057797708.1`
2	Endosome	内体	0.60000	`XP_057797708.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057797708.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057797708.1`
5	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.20000	`XP_057797708.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:43572300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:43572303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B11,B45
`Chr2:43572374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B110,C53
`Chr2:43572521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:43573743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B45
`Chr2:43573798`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	90	A1,A13,A15,A16,A18,A20,A23,A25,A3,A5,A6,A8,A9,B1,B100,B104,B105,B108,B110,B114,B117,B118,B121,B125,B129,B134,B136,B138,B14,B18,B19,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B29,B31,B32,B36,B4,B41,B44,B47,B5,B52,B59,B60,B61,B7,B72,B75,B78,B86,B9,B91,B94,B95,B97,B99,C1,C10,C14,C15,C17,C24,C27,C28,C29,C34,C35,C41,C43,C47,C49,C51,C54,C56,C59,C6,C65,C70,C75,C77,C85,D1,D10,D11,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797708.1

273 aa

136

273

Cytochrom_B561

PF03188 Cytochrom_B561 50-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797708.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	50	177	7.3e-10	39.9	Eukaryotic cytochrome b561

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941725.1
CATTTTCACCAAAAGAAACAAATTTAAAAAGCACAATCTAGTCCCATCTATTGCCACACAACCTTAGATCATCCAAAAAGACAACCTTCAATTCCCCAAATACCTCAAAAGTTCAAAACCTCCATCTAAAATCCATACATTCTTGAAGGAACAAAAAATGTCTCCTTTAAGAATTTTGTGTGCTGCCATAGCTCTTCTGCTTCTTGCACATTTCCCTGAATCTTCATCATACAAACAGCAAGATTCCAGCAGCCGTGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013602
ATGTCTCCTTTAAGAATTTTGTGTGCTGCCATAGCTCTTCTGCTTCTTGCACATTTCCCTGAATCTTCATCATACAAACAGCAAGATTCCAGCAGCCGTGGCTTCGACGAACACCATGAGAGTTCTCAGAAGGTGTTTGATATTTTAGTTCATGGAATCTTGTTGTGGGCATCAATGGGATTCTTGATTCCTTTAGGAATATTGGTAATGAGAATTTCGAGCTGCAGAAGTGATTTTCAACCTTCTAGGCATAAAACAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797708.1
MSPLRILCAAIALLLLAHFPESSSYKQQDSSSRGFDEHHESSQKVFDILVHGILLWASMGFLIPLGILVMRISSCRSDFQPSRHKTVFYVHAVLQVLSVLLVTAGAILSIRNFENAFNNTHQRIGLALYAAIYMQLILGFKRPKRGTRARSAWYFLHWLLGTITCLVGILNIYTGLQAYHKRTSTNTATYTIIFTAQLSFMIIVYLFQDKWDYILRQGMPPGIVGSDPNNPLTSSQQVEDQIRDLLNEPCRKSNALGTHF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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