当前解析结果
SmilChr02G002520| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002520 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002520 |
| 描述 | glutamine synthetase cytosolic isozyme 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 43776311 - 43778821 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131013611 |
|---|---|
| GeneID | 131013611 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131013611 |
| 原始查询 | SmilChr02G002520 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glutamine synthetase cytosolic isozyme 2-like |
| 产物 | glutamine synthetase cytosolic isozyme 2-like |
| Arabidopsis | AT1G66200 (GSR2)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842935] identity=93.8; qcov=0.414; evalue=4.95e-27; confidence=low |
| Rice | Os02g0735200 (OsGS1)- identity=67.5; qcov=0.664; evalue=1.18e-27; confidence=medium |
| GO | GO:0004356 (glutamine synthetase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006542 (GO:0006542) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131013611 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057797726.1 |
| 2 | Peroxisome | 过氧化物酶体 | 0.20000 | XP_057797726.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057797726.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057797726.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057797726.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:43777913 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,B34 |
Chr2:43777965 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr2:43777972 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C55,C83,D8 |
Chr2:43778330 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C49 |
Chr2:43778336 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C42 |
Chr2:43778618 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C13,C69,C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。