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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002527`

染色体: Chr02 坐标: 43975618-43981979 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002527`
名称	SmilChr02G002527
描述	uncharacterized SmilChr02G002527
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	43975618 - 43981979 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013619`
GeneID	`131013619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013619`
原始查询	`SmilChr02G002527`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SKD1; symbol=SKD1; hit=Os01g0757400; species=rice; confidence=high
产物	SKD1; symbol=SKD1; hit=Os01g0757400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G34560` (CCP1) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818020] identity=71.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0757400` (SKD1) - identity=78.2; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF17862 (AAA_lid_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797733.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797733.1`
3	Midbody	Midbody	0.60000	`XP_057797733.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057797733.1`
5	Spindle	Spindle	0.40000	`XP_057797734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:43976899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C25
`Chr2:43978273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B112,C34
`Chr2:43980774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B65,C19
`Chr2:43981599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A9,D1
`Chr2:43981616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797733.1

404 aa

202

404

AAA

AAA_lid_3

PF00004 AAA 161-292 aa PF17862 AAA_lid_3 316-352 aa

XP_057797734.1

395 aa

198

395

AAA

AAA_lid_3

PF00004 AAA 152-283 aa PF17862 AAA_lid_3 307-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797733.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	161	292	3.8e-41	141.3	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057797733.1`	Pfam	`PF17862`	AAA_lid_3	Domain	316	352	4.3e-13	49.2	AAA+ lid domain
`XP_057797734.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	152	283	3.6e-41	141.4	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057797734.1`	Pfam	`PF17862`	AAA_lid_3	Domain	307	343	4.2e-13	49.3	AAA+ lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941750.1
GGCTCGACCACTGCCAGGGCTGGCCAGCAAGACAATATCAGCTGGGCCCATCTTCTCTCTGCATTGCTCAACAGCTTACACCACTCAGTAGACTCGAGAGAGAATCTCCTCATCAATATCACGAGCAGATTTTCCCAATTTATTTATTACTACATTACATATTTTAGTGATTTCCTTCTCATAATTTTCCATTTCTCTCACTACTTATTCACCTGAAAGGGGAGAAAGCACATGCTCGATCTCCACCCCCTCACTACATA...

XM_057941751.1
GGCTCGACCACTGCCAGGGCTGGCCAGCAAGACAATATCAGCTGGGCCCATCTTCTCTCTGCATTGCTCAACAGCTTACACCACTCAGTAGACTCGAGAGAGAATCTCCTCATCAATATCACGAGCAGATTTTCCCAATTTATTTATTACTACATTACATATTTTAGTGATTTCCTTCTCATAATTTTCCATTTCTCTCACTACTTATTCACCTGAAAGGGGAGAAAGCACATGCTCGATCTCCACCCCCTCACTACATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013619
ATGGCCGACGAGCCCATGCCCACGCGCTGGTCGTTTCAGGAATTTAAATTGTTTTATGATTCCAAGTTTGGGAGGAAGAGGGAGTCTGAGCGGAAAGATACAGCTGCAAATGGTCACCCAGTGTCTAATGGAGGTCATTCAAATGGAACGGTCAATGGAAGTACTAGTGTGAAGAACACATCTGACTTGGCTATCTATGAACAATTCAGGAACCAGAATGGCGGGAATGTGGTCCAATCTAATGGAGCACCTCTAGGACA...

LOC131013619
ATGGCCGACGAGCCCATGCCCACGCGCTGGTCGTTTCAGTTTGGGAGGAAGAGGGAGTCTGAGCGGAAAGATACAGCTGCAAATGGTCACCCAGTGTCTAATGGAGGTCATTCAAATGGAACGGTCAATGGAAGTACTAGTGTGAAGAACACATCTGACTTGGCTATCTATGAACAATTCAGGAACCAGAATGGCGGGAATGTGGTCCAATCTAATGGAGCACCTCTAGGACAAGACGATAAACCGCAAAGATCTTTACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797733.1
MADEPMPTRWSFQEFKLFYDSKFGRKRESERKDTAANGHPVSNGGHSNGTVNGSTSVKNTSDLAIYEQFRNQNGGNVVQSNGAPLGQDDKPQRSLLPPCESAEVRALAESLCRDIIRGSPDVKWETIKGLENAKRLLKEAVVMPIKYPQYFTGLLTPWKGILLFGPPGTGKTMLAKAVATECKTTFFNISASSIVSKWRGDSEKLVKVLFELARHHAPSTIFLDEIDAIISQRGEGRSEHEASRRLKTELLIQMDGLTKT...

XP_057797734.1
MADEPMPTRWSFQFGRKRESERKDTAANGHPVSNGGHSNGTVNGSTSVKNTSDLAIYEQFRNQNGGNVVQSNGAPLGQDDKPQRSLLPPCESAEVRALAESLCRDIIRGSPDVKWETIKGLENAKRLLKEAVVMPIKYPQYFTGLLTPWKGILLFGPPGTGKTMLAKAVATECKTTFFNISASSIVSKWRGDSEKLVKVLFELARHHAPSTIFLDEIDAIISQRGEGRSEHEASRRLKTELLIQMDGLTKTDELVFVLAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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