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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002530`

染色体: Chr02 坐标: 44006407-44008859 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002530`
名称	SmilChr02G002530
描述	F-box/kelch-repeat protein At1g30090
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	44006407 - 44008859 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013621`
GeneID	`131013621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013621`
原始查询	`SmilChr02G002530`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At1g30090
产物	F-box/kelch-repeat protein At1g30090
Arabidopsis	`AT1G30090` (AT1G30090) Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839888] identity=65.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0153400` (OsFbox340) - identity=63.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF01344 (Kelch_1); PF25210 (Kelch_FKB95)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797737.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057797737.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057797737.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797737.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797737.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:44006586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr2:44006720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B63,B81,B83
`Chr2:44007079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C68
`Chr2:44007091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr2:44007123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:44007130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr2:44007149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:44007326`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr2:44007576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797737.1

405 aa

202

405

F-box

Kelch_FKB95

Kelch_1

PF00646 F-box 54-91 aa PF25210 Kelch_FKB95 160-331 aa PF01344 Kelch_1 195-241 aa

XP_057797738.1

405 aa

202

405

F-box

Kelch_FKB95

Kelch_1

PF00646 F-box 54-91 aa PF25210 Kelch_FKB95 160-331 aa PF01344 Kelch_1 195-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797737.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	54	91	5.8e-06	26.7	F-box domain
`XP_057797737.1`	Pfam	`PF25210`	Kelch_FKB95	Repeat	160	331	1.2e-20	75.0	FKB95, Kelch-repeats domain
`XP_057797737.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	195	241	5.6e-20	71.2	Kelch motif
`XP_057797738.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	54	91	5.8e-06	26.7	F-box domain
`XP_057797738.1`	Pfam	`PF25210`	Kelch_FKB95	Repeat	160	331	1.2e-20	75.0	FKB95, Kelch-repeats domain
`XP_057797738.1`	Pfam	`PF01344`	Kelch_1	Repeat	195	241	5.6e-20	71.2	Kelch motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941754.1
TGTTGTTTGGAGGCTGGACCATTCGATCTTGCACGAATGAAGATATCATTCCTTTTTATACACTCAACCATGATAAATACCATACAATTTCCCAACTGAAAAACGCCAAAAGATCTCCATAAAAAAGTAATCTTTCCTGGTAAATCATTCGCTACCGTGAAATCTGCGAGAGCCCCCCATGTTTTAATCAAACTGTTTCTCATTCAACAATCAATCCTTGCGTGTAAAGACTTTTGTGACTCTTGGATGCTGAAAGTTTG...

XM_057941755.1
CCCTTCATTTTTTCCTTTCTTTTTGGCCCTTTGAAATTTTTTTATTTGAATTTTTATTGTTACTGTTTGTTTGCCCTAATAAAAAAGTTCCTTTCTTGAACTACTTTCTGCTTTACCCGTGTGTTGTAATTTTTTTTACTTTCGCTTAATTGGGTTTTTGACATCTGAATTATTGAAATCTTGCACCTTTTGGTTTGTGGGTTTTCTTGAATTCTGAGCTCTTGCTGTAATAATACTGTGTTGGATGTGAATTGGGGTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013621
ATGCAAAGAGTTCGAGTGTCATCACATCAGTCTCCGGTGCATAAGCTGGGGGATTCGCAGATGACCTTGTCTCCGAAGTTTAAGTTAGCTGCAACGTGTTCAGCTTTGCTCGATCCTGCACTAGAATTCGAGCTATCTATGAGGGGGGAGCCTTTGATTCCTGGACTTCCGGATGATGTAGCTCTGCAGTGCCTCCTTCGCGTGCCAGTCGATAAGCACACAGCTTGCAAGTTTGTCTCAAGACGTTGGTACTCGTTGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797737.1
MQRVRVSSHQSPVHKLGDSQMTLSPKFKLAATCSALLDPALEFELSMRGEPLIPGLPDDVALQCLLRVPVDKHTACKFVSRRWYSLFGSKEQFFTLRKELGFHDPWLFVFAYHKCTGKIEWKVLDLTHLSWHTIPAMPCKDKVCPQGFRCVSIPHEGALFVCGGVVSDVDCPLNLVLKYEARRNRWTVMKKMIAARSFFASGVIDGMIYVAGGNSTDLFELNSAEVLDPKKGTWRPVASMGTNMASYDAAVLNGKLLVTE...

XP_057797738.1
MQRVRVSSHQSPVHKLGDSQMTLSPKFKLAATCSALLDPALEFELSMRGEPLIPGLPDDVALQCLLRVPVDKHTACKFVSRRWYSLFGSKEQFFTLRKELGFHDPWLFVFAYHKCTGKIEWKVLDLTHLSWHTIPAMPCKDKVCPQGFRCVSIPHEGALFVCGGVVSDVDCPLNLVLKYEARRNRWTVMKKMIAARSFFASGVIDGMIYVAGGNSTDLFELNSAEVLDPKKGTWRPVASMGTNMASYDAAVLNGKLLVTE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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