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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002572`

染色体: Chr02 坐标: 44729135-44729890 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002572`
名称	SmilChr02G002572
描述	uncharacterized SmilChr02G002572
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	44729135 - 44729890 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009581`
GeneID	`131009581`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009581`
原始查询	`SmilChr02G002572`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=29.4; qcov=0.801; evalue=1.69e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=30.2; qcov=0.896; evalue=8e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009581

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057792978.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057792978.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792978.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792978.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792978.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:44729138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C41
`Chr2:44729151`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A23,A24,B112,B62,C34,C62,C78,C82
`Chr2:44729152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B104,B27,C74,C84
`Chr2:44729154`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B104,B119,B27,C58,C85
`Chr2:44729154`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B104,B119,B27,C58,C85
`Chr2:44729156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A10,B111,B114,B118,B134,B16,B69,C26,C76,C82,D11,D4
`Chr2:44729162`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B104,B119,B25,B27,C58,C85
`Chr2:44729167`	`G`	`GT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	8	B104,B119,B122,B137,B25,B27,C58,C85
`Chr2:44729176`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B104,B119,B122,B137,B25,B27,B66,B76,C58,C85
`Chr2:44729195`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B104,B119,B122,B137,B25,B27,B66,B76,C2,C58,C85
`Chr2:44729204`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B104,B119,B122,B137,B25,B27,B66,B76,C2,C58,C85
`Chr2:44729210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A23,A24,B112,B37,B62,C34,C62,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792978.1

251 aa

126

251

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 57-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792978.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	57	150	4.4e-18	66.4	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936995.1
ATGGGAGTTTGGGTTGAGGGGCAGTGGTGTTGGGATTTCTCGTGGAATCGGGATCTCTCGGGGAGAGAACTTGATCAGCTTTCTAACCTTTTTTCTATCATCAGAAAATTTCAAGTGGTGGCAGGTGAAACAGACGGATGGAGGTGGAAAGCATCTCCAAACGGAGTTTTCTCCGTCAAGACGGCTTACAAGTCTTTGTGCCTTGAGACAAATCCCTCCAGTTCCAGCCGAGAAGTGTTGGAGTGGAAGCAGATCTGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009581
ATGGGAGTTTGGGTTGAGGGGCAGTGGTGTTGGGATTTCTCGTGGAATCGGGATCTCTCGGGGAGAGAACTTGATCAGCTTTCTAACCTTTTTTCTATCATCAGAAAATTTCAAGTGGTGGCAGGTGAAACAGACGGATGGAGGTGGAAAGCATCTCCAAACGGAGTTTTCTCCGTCAAGACGGCTTACAAGTCTTTGTGCCTTGAGACAAATCCCTCCAGTTCCAGCCGAGAAGTGTTGGAGTGGAAGCAGATCTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792978.1
MGVWVEGQWCWDFSWNRDLSGRELDQLSNLFSIIRKFQVVAGETDGWRWKASPNGVFSVKTAYKSLCLETNPSSSSREVLEWKQIWKAPATFKAVTIAWKVLKGRLTTCDNLQKRNVAITNMEAICVLCKTKAEFIDHLFFECFKSEEIWKEIIRWIGKQAASQQKAKEHLLAFTNLGNKKDVSFLSGVWICTIWCIWKERNDCKFNQKKWSKGKLVAEIKSRMWGWRMAFNCPIFATEFRQWFTMVKLSD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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