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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002590`

染色体: Chr02 坐标: 45019256-45020461 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002590`
名称	SmilChr02G002590
描述	uncharacterized SmilChr02G002590
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	45019256 - 45020461 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009588`
GeneID	`131009588`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009588`
原始查询	`SmilChr02G002590`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=37.4; qcov=0.73; evalue=3.73e-32; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=29.9; qcov=1.25; evalue=2.05e-39; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009588

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792985.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057792985.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792985.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792985.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792985.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:45019304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B21,C58
`Chr2:45019316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,D5
`Chr2:45019372`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B12,B67,B99,C28,C31,C69,C71,D11,D5
`Chr2:45019381`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	39	A23,A7,A8,B100,B106,B110,B115,B117,B120,B126,B128,B24,B25,B26,B27,B32,B35,B37,B39,B40,B44,B53,B58,B65,B71,B72,B78,B80,B87,B95,B97,C13,C14,C23,C45,C59,C82,C84,C87
`Chr2:45019388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B95
`Chr2:45019388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr2:45019394`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A4
`Chr2:45019394`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A4
`Chr2:45019448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B34,C49,C71,C72
`Chr2:45019451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:45019471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C31,C69,D11
`Chr2:45019472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792985.1

282 aa

141

282

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 25-63 aa PF04827 Plant_tran 167-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792985.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	25	63	2.9e-17	62.9	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057792985.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	167	216	2.8e-14	53.9	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937002.1
ATGTACTCCCAATCAGAGCCAGAACGTGTTGTTCATCATCGAAAATACGTCCACTGTGATCGTGAGGCTACCCATTTACGTCTTATACAAGACTACTTCAACGAAAATCCGACGTACGGGCCTACATTTTTTCGACGTCATTTTTGGATGCAGAAGGAGTTGTTCTTGTGCATCGTCAAGGCTGTTCAAGGTGAAGATACTTATTTTCAGATGAGCCATGATGCACGAGGTCGAGACTCTCTCATGCCTTTGCAGAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009588
ATGTACTCCCAATCAGAGCCAGAACGTGTTGTTCATCATCGAAAATACGTCCACTGTGATCGTGAGGCTACCCATTTACGTCTTATACAAGACTACTTCAACGAAAATCCGACGTACGGGCCTACATTTTTTCGACGTCATTTTTGGATGCAGAAGGAGTTGTTCTTGTGCATCGTCAAGGCTGTTCAAGGTGAAGATACTTATTTTCAGATGAGCCATGATGCACGAGGTCGAGACTCTCTCATGCCTTTGCAGAAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792985.1
MYSQSEPERVVHHRKYVHCDREATHLRLIQDYFNENPTYGPTFFRRHFWMQKELFLCIVKAVQGEDTYFQMSHDARGRDSLMPLQKCTTAIRQLATGVSANTFDEYLKVIDTTGRLCLKRFYKAVIWAYSGEYLRRPTQADIQRLIQMHEARHRFPRMLGSLDSAPLIFEANQRYYHMGYYLCDDIYPEWRCFVKSPPMATNPKEVSMIVENEGERAAHWRDDDAGHRASSSDSSESARATPVCFEQYMQRDAILRDRQI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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