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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002607`

染色体: Chr02 坐标: 45236292-45237506 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002607`
名称	SmilChr02G002607
描述	uncharacterized SmilChr02G002607
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	45236292 - 45237506 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011660`
GeneID	`131011660`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011660`
原始查询	`SmilChr02G002607`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0480300; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0480300; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=27.6; qcov=0.698; evalue=9.57e-13; confidence=low
Rice	`Os09g0480300` - identity=35.9; qcov=0.644; evalue=9.56e-32; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011660

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795422.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795422.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795422.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057795422.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057795422.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:45236530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B124,B50
`Chr2:45236758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,D8
`Chr2:45236889`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B59,B75,C1,C86
`Chr2:45236889`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B59,B75,C1,C86
`Chr2:45236920`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	A10,A21,A22,B131,B140,B19,B23,B59,B69,B75,B9,C1,C17,C44,C49,C61,C63,C76,D11
`Chr2:45236937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B87,C70
`Chr2:45236951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr2:45236972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,C21
`Chr2:45236984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:45237015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr2:45237068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C79
`Chr2:45237084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795422.1

281 aa

140

281

SWIM

PF04434 SWIM 61-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795422.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	61	97	9e-10	38.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939439.1
TTCAATGGATACATAATAGCAGCGAGGGGCATGCATCTCATACATATGTGTGAGCAGATAAGAAGAGATCTCATGGTAAGGCAGGTAGAAAAATTGAAAACGATGGCTGGGGTTAGTGATAGGGTGTGTCCAGCCATAATGAGGGCTCTTGAAAAAACTATGGCTAAGAGTGTGACAGCTTATGTTTTTCCTAACATGACAAAGAAATATGAGGTGAGTTATGAAGGAAGGGCTTTTGTTGTTGATGTGAATGCGAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011660
ATGCATCTCATACATATGTGTGAGCAGATAAGAAGAGATCTCATGGTAAGGCAGGTAGAAAAATTGAAAACGATGGCTGGGGTTAGTGATAGGGTGTGTCCAGCCATAATGAGGGCTCTTGAAAAAACTATGGCTAAGAGTGTGACAGCTTATGTTTTTCCTAACATGACAAAGAAATATGAGGTGAGTTATGAAGGAAGGGCTTTTGTTGTTGATGTGAATGCGAGAAGTTGCACATGTAGGGCATGGGATGTCACTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057795422.1
MHLIHMCEQIRRDLMVRQVEKLKTMAGVSDRVCPAIMRALEKTMAKSVTAYVFPNMTKKYEVSYEGRAFVVDVNARSCTCRAWDVTGIPCLHACAAINFEGEEPSAYVHTYYTVERYLEAYKYAIEPLVSEEMWPTAEGHPVKPPLIRKLPGRPKKVRRRDPEEDPKNPHKLKRFGLRMTCTNCHQKGHNIKTCKNEKAPPKPKGKRGRPRIHPIQPPRPKKSKGEQTTTSSEQVQTRPRTEFIPPRSTRLQQQNQSSSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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