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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002613`

染色体: Chr02 坐标: 45307198-45309376 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002613`
名称	SmilChr02G002613
描述	uncharacterized SmilChr02G002613
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	45307198 - 45309376 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009594`
GeneID	`131009594`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009594`
原始查询	`SmilChr02G002613`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0307600` - identity=25; qcov=0.36; evalue=3.33e-08; confidence=low
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009594

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057792991.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057792991.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057792991.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057792991.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057792991.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:45307212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C54,D1
`Chr2:45307316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr2:45307579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr2:45307659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:45307693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A15,B108,C52
`Chr2:45307693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B108,C52
`Chr2:45307694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A7,B123,B41,C74
`Chr2:45307717`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A4,B33,B44,B5,B52,B58,C16,C20,C23,C38,C4,D4
`Chr2:45307727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B87,C22,C26,D9
`Chr2:45307744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B130,B74
`Chr2:45307748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:45307760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A2,A8,B132,B136,B19,B70,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792991.1

566 aa

283

566

DUF8566

Peptidase_C48

PF29561 DUF8566 86-287 aa PF02902 Peptidase_C48 391-502 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792991.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	86	287	3.1e-47	161.7	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057792991.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	391	502	1.1e-06	29.4	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937008.1
ATGCTGCCAACAACGCGAAAAACACCTATTTCATTTCGACCTGCTAGTCGCATCAATATATTTGATGTTACCCCTGTCAAATCCACAGGTTATAACAAGAAGTATCCAAACACTAATGTCAAATATTCTGAACCAGTAACCGTAAGGAATGAATGCATTGTTGTTGACGATGATAATGGTGGAGAGCTTGTAAGCAAAGCTAATTCCATCGGTTGTCCATCTCAGATAACTAGATCAAAAGTTTTATCTTTGAATACAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009594
ATGCTGCCAACAACGCGAAAAACACCTATTTCATTTCGACCTGCTAGTCGCATCAATATATTTGATGTTACCCCTGTCAAATCCACAGGTTATAACAAGAAGTATCCAAACACTAATGTCAAATATTCTGAACCAGTAACCGTAAGGAATGAATGCATTGTTGTTGACGATGATAATGGTGGAGAGCTTGTAAGCAAAGCTAATTCCATCGGTTGTCCATCTCAGATAACTAGATCAAAAGTTTTATCTTTGAATACAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792991.1
MLPTTRKTPISFRPASRINIFDVTPVKSTGYNKKYPNTNVKYSEPVTVRNECIVVDDDNGGELVSKANSIGCPSQITRSKVLSLNTRTTLASFHDSLLKLNAAQQDAIRDTGFGYLLDLTVKELPGRLAYWALKSFNPKTCELEISSNFRLKVTVDDVYRVFGLPKGVQRIKRFDRQMNHALFDEWFSLFGVGNRDKIKIGLVLNEMVRCKNGGTWFKRHFMIAMCFSLFESFSNVTVHPHILYTLFDVDNLDKWDWAEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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