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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002616`

染色体: Chr02 坐标: 45393750-45408835 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002616`
名称	SmilChr02G002616
描述	uncharacterized SmilChr02G002616
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	45393750 - 45408835 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011664`
GeneID	`131011664`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011664`
原始查询	`SmilChr02G002616`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241299]; symbol=AT1G21651; hit=AT1G21651; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241299]; symbol=AT1G21651; hit=AT1G21651; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G21651` (AT1G21651) zinc ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241299] identity=37; qcov=1.01; evalue=8.02e-127; confidence=medium
Rice	`Os05g0422300` - identity=29.1; qcov=1.03; evalue=3.28e-72; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011664

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057795427.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057795425.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057795425.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057795425.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057795425.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:45393827`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	45	A11,A19,A3,A6,A8,B1,B105,B111,B120,B132,B137,B139,B14,B19,B29,B32,B37,B4,B42,B43,B6,B60,B66,B75,B86,B87,B97,B99,C10,C11,C28,C35,C37,C4,C40,C42,C46,C50,C52,C67,C69,C71,C75,C9,D8
`Chr2:45394205`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr2:45394205`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr2:45394332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr2:45394755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:45395559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C2
`Chr2:45407443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr2:45407569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B24,B29,C51
`Chr2:45407799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B22,C25,D9
`Chr2:45407857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr2:45408053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B71,B9
`Chr2:45408108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057795425.1

884 aa

442

884

WD40

PF00400 WD40 593-624 aa PF00400 WD40 630-667 aa PF00400 WD40 723-755 aa PF00400 WD40 804-835 aa

XP_057795426.1

844 aa

422

844

WD40

PF00400 WD40 554-585 aa PF00400 WD40 591-628 aa PF00400 WD40 684-716 aa PF00400 WD40 765-796 aa

XP_057795427.1

682 aa

341

682

WD40

PF00400 WD40 554-585 aa PF00400 WD40 590-628 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057795425.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	593	624	7.9e-22	77.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795425.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	630	667	7.9e-22	77.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795425.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	723	755	7.9e-22	77.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795425.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	804	835	7.9e-22	77.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795426.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	554	585	1.2e-22	80.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795426.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	591	628	1.2e-22	80.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795426.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	684	716	1.2e-22	80.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795426.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	765	796	1.2e-22	80.0	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795427.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	554	585	1.9e-09	38.3	WD domain, G-beta repeat
`XP_057795427.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	590	628	1.9e-09	38.3	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057939442.1
CACATGTGTTCGATTTTTACAAAGCATACACACAAAATGACAAAATATTCAGATTGGTTAGGCTATTTTAGTACAATATTTTTTTTCTTTTCCCTACTCCGCGGTAAAAAAATAACCAAGATGCAGCAAGTCAATGATCCGCCGCCGCCGTCCGCCGTGGAGGAGCCAGAGCCGCCGGAGTGCCCGGTATGTCTGCAGCCTTACGACGCTGTGACAGCCATCCCGCGCGTCCTGAGCTGCGGCCAGACCACCTGCGAAGC...

XM_057939443.1
AATATTTTTTTTCTTTTCCCTACTCCGCGGTAAAAAAATAACCAAGATGCAGCAAGTCAATGATCCGCCGCCGCCGTCCGCCGTGGAGGAGCCAGAGCCGCCGGAGTGCCCGGTATGTCTGCAGCCTTACGACGCTGTGACAGCCATCCCGCGCGTCCTGAGCTGCGGCCAGACCACCTGCGAAGCCTGCCTGAAGTTGCTCCCCCGCCCATTCCCTAACACTATCCGGTGCACCGTCTGCACCCTCCTCCTCAAATTAC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131011664
ATGTGTTCGATTTTTACAAAGCATACACACAAAATGACAAAATATTCAGATTGGTTAGGCTATTTTAGTACAATATTTTTTTTCTTTTCCCTACTCCGCGGTAAAAAAATAACCAAGATGCAGCAAGTCAATGATCCGCCGCCGCCGTCCGCCGTGGAGGAGCCAGAGCCGCCGGAGTGCCCGGTATGTCTGCAGCCTTACGACGCTGTGACAGCCATCCCGCGCGTCCTGAGCTGCGGCCAGACCACCTGCGAAGCCTG...

LOC131011664
ATGCAGCAAGTCAATGATCCGCCGCCGCCGTCCGCCGTGGAGGAGCCAGAGCCGCCGGAGTGCCCGGTATGTCTGCAGCCTTACGACGCTGTGACAGCCATCCCGCGCGTCCTGAGCTGCGGCCAGACCACCTGCGAAGCCTGCCTGAAGTTGCTCCCCCGCCCATTCCCTAACACTATCCGGTGCACCGTCTGCACCCTCCTCCTCAAATTACCCAACTCGCTCTCTTCGCTCCCCAAGAACCTCGACCTCCTCTATTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057795425.1
MCSIFTKHTHKMTKYSDWLGYFSTIFFFFSLLRGKKITKMQQVNDPPPPSAVEEPEPPECPVCLQPYDAVTAIPRVLSCGQTTCEACLKLLPRPFPNTIRCTVCTLLLKLPNSLSSLPKNLDLLYFSSLLHRTRPLEEKTVIPPGTKSASPPSVLKPWPHEFYCRWRRWILPEDCISIGGARLDSDGGVLDGIVLRFFGSDRVMGCVLREKEYVGLVKVGILVEGSKLIKPSYESGILTVLWGMGEEERDKLGVILNAGF...

XP_057795426.1
MQQVNDPPPPSAVEEPEPPECPVCLQPYDAVTAIPRVLSCGQTTCEACLKLLPRPFPNTIRCTVCTLLLKLPNSLSSLPKNLDLLYFSSLLHRTRPLEEKTVIPPGTKSASPPSVLKPWPHEFYCRWRRWILPEDCISIGGARLDSDGGVLDGIVLRFFGSDRVMGCVLREKEYVGLVKVGILVEGSKLIKPSYESGILTVLWGMGEEERDKLGVILNAGFRVSNVGKAYGFWCDEADKSVYIVFQKFASSNFITDCVFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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