当前解析结果
SmilChr02G002618| 统一新 Gene ID | SmilChr02G002618 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G002618 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G002618 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 45491760 - 45493250 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009597 |
|---|---|
| GeneID | 131009597 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009597 |
| 原始查询 | SmilChr02G002618 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=29.8; qcov=0.423; evalue=3.57e-17; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009597 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057792995.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057792995.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057792995.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057792995.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057792995.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:45491816 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A15,C13 |
Chr2:45491817 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B103 |
Chr2:45491827 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A15,C13 |
Chr2:45491871 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B57,B88,C27,C55 |
Chr2:45491877 |
CAT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 20 | A11,A6,A7,B110,B122,B126,B25,B38,B44,B53,B65,B72,B78,B80,B9,C13,C19,C59,C74,C84 |
Chr2:45491898 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B93,C80 |
Chr2:45491934 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B93,C80 |
Chr2:45491936 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B109,C80 |
Chr2:45491943 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B109,B93,C80 |
Chr2:45491957 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B135 |
Chr2:45491964 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,B109,B135,C80 |
Chr2:45492015 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B109,C68 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。